27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TM1040_1374 on replicon NC_008044
Organism: Ruegeria sp. TM1040



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_2813  putative trimethylamine methyltransferase protein  81.26 
 
 		 513 aa  890    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.94532  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1586  trimethylamine methyltransferase  73.89 
 
 		 515 aa  788    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.091176 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1775  trimethylamine methyltransferase  64.32 
 
 		 523 aa  680    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.445746  normal  0.0169643 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1716  trimethylamine methyltransferase  79.49 
 
 		 513 aa  876    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1485  trimethylamine methyltransferase  81.26 
 
 		 513 aa  890    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.355063 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1374  trimethylamine methyltransferase  100 
 
 		 514 aa  1069    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.181279  normal  0.561281 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2223  trimethylamine methyltransferase  75.92 
 
 		 519 aa  800    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0727835  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0432  trimethylamine methyltransferase  52.34 
 
 		 514 aa  548  1e-155  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.57949 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_4008  trimethylamine methyltransferase MttB-like protein  43.72 
 
 		 517 aa  424  1e-117  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4326  trimethylamine methyltransferase  43.62 
 
 		 476 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5110  trimethylamine methyltransferase  39.11 
 
 		 511 aa  346  5e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.148591  normal  0.0268 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2171  trimethylamine methyltransferase  39.58 
 
 		 519 aa  325  1e-87  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2817  trimethylamine methyltransferase  39.26 
 
 		 519 aa  325  1e-87  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.322933 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3128  trimethylamine methyltransferase  36.94 
 
 		 519 aa  312  1e-83  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.186988 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1728  trimethylamine methyltransferase  35.85 
 
 		 468 aa  304  2.0000000000000002e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1480  trimethylamine methyltransferase  34.9 
 
 		 504 aa  260  5.0000000000000005e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.246816  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4870  trimethylamine methyltransferase  30.24 
 
 		 471 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1730  trimethylamine methyltransferase  30.15 
 
 		 476 aa  233  8.000000000000001e-60  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1111  trimethylamine methyltransferase  29.93 
 
 		 477 aa  155  1e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1467  trimethylamine methyltransferase  29.07 
 
 		 475 aa  144  4e-33  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.657417  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2196  trimethylamine methyltransferase  28.35 
 
 		 515 aa  140  7e-32  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.726169  normal  0.0249969 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2313  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  24.14 
 
 		 484 aa  129  8.000000000000001e-29  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0209756  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1601  trimethylamine methyltransferase  25.89 
 
 		 510 aa  124  5e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.38036  normal  0.479948 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2308  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  36.36 
 
 		 334 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.0038557  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2309  trimethylamine:corrinoid methyltransferase  25.35 
 
 		 147 aa  52.4  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00021948  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1106  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  28.05 
 
 		 417 aa  51.2  0.00005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.491742  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1109  trimethylamine:corrinoid methyltransferase-like protein  21.79 
 
 		 410 aa  48.9  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>