16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_1117 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_1117  putative outer-membrane protein  100 
 
 		 208 aa  396  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0367384  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2334  OmpA domain protein transmembrane region-containing protein  47.85 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1500  putative outer-membrane protein  36.6 
 
 		 218 aa  95.9  4e-19  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.733507 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4199  hypothetical protein  27.57 
 
 		 228 aa  49.3  0.00004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0419  porin  27.4 
 
 		 225 aa  49.3  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.647021 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1303  hypothetical protein  33.14 
 
 		 185 aa  48.9  0.00006  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.13528  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4378  putative outer-membrane protein, putative secreted protein  33.58 
 
 		 212 aa  48.5  0.00006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.71482  normal  0.0231919 
 
 
-
 
NC_004310  BR0119  outer membrane protein, putative  27.23 
 
 		 228 aa  46.6  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.109473  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0423  outer membrane protein, 31 kDa  27.92 
 
 		 240 aa  47.4  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.91759  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0366  outer membrane protein Omp31  27.92 
 
 		 240 aa  46.2  0.0003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.658451  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3008  hypothetical protein  30 
 
 		 172 aa  45.4  0.0006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0116  putative outer membrane protein  26.24 
 
 		 228 aa  45.1  0.0007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1622  outer membrane protein Omp31  25.78 
 
 		 261 aa  44.7  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0890  porin  27.67 
 
 		 255 aa  44.3  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.113086 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5652  porin  30.93 
 
 		 207 aa  44.3  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.303382  normal  0.313957 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3979  putative outer-membrane immunogenic protein precursor  26.27 
 
 		 262 aa  42.4  0.005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>