46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_0648 on replicon NC_013889
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013889  TK90_0648  biotin/lipoate A/B protein ligase  100 
 
 		 348 aa  699    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.435247  normal  0.0871201 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2168  biotin/lipoate A/B protein ligase  40.65 
 
 		 347 aa  216  5e-55  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2168  biotin/lipoate A/B protein ligase  34.95 
 
 		 335 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00545206  hitchhiker  0.000000520925 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2540  biotin/lipoate A/B protein ligase family protein  34.77 
 
 		 303 aa  123  5e-27  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1480  lipoate-protein ligase  27.88 
 
 		 364 aa  87.8  3e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.521497  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2034  biotin/lipoate A/B protein ligase  28 
 
 		 366 aa  87.4  3e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1002  biotin/lipoate A/B protein ligase  28.43 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0682  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.16 
 
 		 275 aa  64.7  0.000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0153413  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0443  biotin/lipoate A/B protein ligase  25.19 
 
 		 530 aa  63.5  0.000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0449  lipoate-protein ligase  24.62 
 
 		 345 aa  60.8  0.00000003  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0102299  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2206  biotin/lipoate A/B protein ligase  24.65 
 
 		 360 aa  58.2  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.46351  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2545  lipoate-protein ligase A, putative  30.41 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.752721  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2173  biotin/lipoate A/B protein ligase  30.41 
 
 		 356 aa  57.8  0.0000003  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.679039  decreased coverage  0.000000000726509 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl038  lipoate-protein ligase  23.49 
 
 		 334 aa  54.3  0.000003  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0642  Lipoate--protein ligase  25.88 
 
 		 363 aa  53.1  0.000007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.336498  normal  0.0925855 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3768  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  21.74 
 
 		 329 aa  52  0.00001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0327  lipoate-protein ligase  23.28 
 
 		 334 aa  50.8  0.00004  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0736  lipoate-protein ligase  25.9 
 
 		 336 aa  49.7  0.00007  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1056  lipoate-protein ligase A  28.12 
 
 		 339 aa  49.3  0.0001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0233  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  29.91 
 
 		 326 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0197  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  20.99 
 
 		 339 aa  47.8  0.0003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006684  CNB01600  conserved hypothetical protein  31.65 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1171  hypothetical protein  28.83 
 
 		 326 aa  47  0.0005  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.268506 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1677  lipoate-protein ligase  26.89 
 
 		 337 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.0374805  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1752  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  20.41 
 
 		 329 aa  45.8  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0224  lipoate-protein ligase  21.48 
 
 		 334 aa  45.1  0.002  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0052  lipoate-protein ligase  20.59 
 
 		 333 aa  44.7  0.002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0386  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.98 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.858676  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1555  lipoate-protein ligase  22.18 
 
 		 325 aa  44.3  0.003  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0376  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  26.98 
 
 		 340 aa  44.3  0.003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2343  biotin/lipoate A/B protein ligase  23.98 
 
 		 510 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.855949  hitchhiker  0.000773035 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1121  putative lipoate-protein ligase A  22.11 
 
 		 329 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2721  lipoate-protein ligase A, putative  23.98 
 
 		 510 aa  43.9  0.004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.966244  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1167  putative lipoate-protein ligase A  22.28 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1017  lipoate-protein ligase A  22.28 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1001  lipoate-protein ligase A  22.28 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1004  lipoate-protein ligase A  22.28 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4185  putative lipoate-protein ligase A  22.28 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1089  lipoate-protein ligase A  22.28 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2663  biotin/lipoate A/B protein ligase  27.5 
 
 		 275 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1248  putative lipoate-protein ligase A  22.28 
 
 		 329 aa  43.5  0.005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0931  biotin/lipoate A/B protein ligase  18.93 
 
 		 343 aa  43.1  0.006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000248179  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1189  lipoate-protein ligase A, putative  22.28 
 
 		 329 aa  43.5  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0839  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  20.49 
 
 		 329 aa  43.1  0.007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1213  lipoyltransferase and lipoate-protein ligase  24.58 
 
 		 329 aa  42.7  0.008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2086  biotin/lipoate A/B protein ligase  21.47 
 
 		 344 aa  42.7  0.01  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>