18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0696 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002967  TDE0696  hypothetical protein  100 
 
 
388 aa  779    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1307  ABC-2 type transporter  26.15 
 
 
371 aa  92  2e-17  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000398946  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1223  ABC-2 type transporter  23.18 
 
 
386 aa  73.6  0.000000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0561  hypothetical protein  21.52 
 
 
411 aa  72  0.00000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10730  ABC-2 type transporter  22.87 
 
 
393 aa  69.3  0.0000000001  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2702  ABC-2 type transporter  20.83 
 
 
780 aa  45.8  0.001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20110  hypothetical protein  21.77 
 
 
377 aa  44.3  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.918672 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5477  putative ABC transporter, permease protein  24.46 
 
 
244 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.975667  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2429  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 
251 aa  43.9  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0140653  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5475  putative ABC transporter, permease protein  24.46 
 
 
244 aa  43.9  0.005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.782818  hitchhiker  0.000000000276191 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2584  ABC-2 type transporter  23.84 
 
 
251 aa  43.5  0.006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.369437  normal  0.0868823 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0966  ABC-2 type transporter  27.81 
 
 
259 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0988  hypothetical protein  21.39 
 
 
374 aa  43.5  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.564547  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5484  ABC transporter, permease protein, putative  23.75 
 
 
244 aa  43.5  0.007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0501  ABC-2 type transporter  22.22 
 
 
379 aa  43.1  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0217  ABC-2 type transporter  21.26 
 
 
380 aa  42.7  0.01  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.623242  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5052  ABC transporter, permease  23.75 
 
 
244 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5036  ABC transporter, permease  23.75 
 
 
244 aa  42.7  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>