18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10799 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10799  hypothetical protein  100 
 
 
228 aa  447  1e-125  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5133  hypothetical protein  72.37 
 
 
236 aa  328  3e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1620  hypothetical protein  69.74 
 
 
234 aa  307  6.999999999999999e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4556  hypothetical protein  66.67 
 
 
234 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4644  hypothetical protein  66.67 
 
 
234 aa  303  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4939  hypothetical protein  66.67 
 
 
234 aa  302  2.0000000000000002e-81  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.250268 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3616  hypothetical protein  56.7 
 
 
232 aa  237  1e-61  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.689056  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6882  deacetylase-like protein  40.64 
 
 
219 aa  117  9.999999999999999e-26  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3284  putative deacetylase  30.21 
 
 
250 aa  73.9  0.000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4879  hypothetical protein  31.1 
 
 
253 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56040  hypothetical protein  30.49 
 
 
253 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17920  hypothetical protein  32.93 
 
 
255 aa  63.5  0.000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00986232  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1369  hypothetical protein  32.37 
 
 
243 aa  55.8  0.0000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4354  hypothetical protein  33.58 
 
 
254 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00552535  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1223  hypothetical protein  27.57 
 
 
258 aa  54.7  0.000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4445  hypothetical protein  32.85 
 
 
254 aa  52.4  0.000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317047  hitchhiker  0.000033336 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4433  hypothetical protein  29.88 
 
 
258 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1009  putative deacetylase  31.34 
 
 
254 aa  45.8  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00774779  hitchhiker  0.00000000000895825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>