32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_2140 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_2140  cytidine deaminase  100 
 
 		 143 aa  294  3e-79  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.621603  normal  0.187784 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3426  cytidine deaminase  42.96 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3387  cytidine deaminase  42.96 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.274562  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3646  cytidine deaminase  42.96 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3696  cytidine deaminase  42.96 
 
 		 142 aa  116  9.999999999999999e-26  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.398657  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3478  cytidine deaminase  44.78 
 
 		 142 aa  115  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3338  cytidine deaminase  44.12 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3668  cytidine deaminase  44.12 
 
 		 142 aa  115  3e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0231868  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6907  hypothetical protein  27.54 
 
 		 139 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.373552 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4804  hypothetical protein  26.12 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.558671  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0681  cytidine deaminase  31.65 
 
 		 129 aa  46.6  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.502786 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1606  hypothetical protein  25.98 
 
 		 131 aa  44.3  0.0006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0081  cytidine deaminase  28.16 
 
 		 132 aa  44.3  0.0006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000394049  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1291  hypothetical protein  26.13 
 
 		 141 aa  43.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006685  CNC04940  cytidine deaminase, putative  26.92 
 
 		 138 aa  42.4  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0896337  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1390  hypothetical protein  28.16 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1273  cytidine deaminase  31.37 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1068  cytidine deaminase  26.15 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1386  cytidine deaminase  30.95 
 
 		 133 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.67349  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3235  cytidine deaminase  36.05 
 
 		 136 aa  42  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2739  cytidine deaminase  32.99 
 
 		 129 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3340  cytidine deaminase  26.62 
 
 		 152 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.568351 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0939  cytidine deaminase  33.68 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.743414  normal  0.851216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1779  cytidine deaminase  32.56 
 
 		 133 aa  41.6  0.004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.713344  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1988  cytidine deaminase  29.25 
 
 		 132 aa  41.6  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1024  cytidine deaminase  34.23 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2273  cytidine deaminase  29.25 
 
 		 132 aa  41.2  0.005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4051  cytidine deaminase  36.36 
 
 		 151 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0081  cytidine deaminase  26.21 
 
 		 132 aa  40.8  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000436242  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1828  cytidine deaminase  27.72 
 
 		 132 aa  40.4  0.007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4399  cytidine deaminase  34.88 
 
 		 135 aa  40.4  0.009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4168  hypothetical protein  25.66 
 
 		 142 aa  40.4  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.250781  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>