28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1979 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007604  Synpcc7942_1979  membrane protein-like  100 
 
 		 240 aa  472  1e-132  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.460955  normal  0.262447 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2010  NnrU  68.26 
 
 		 237 aa  320  9.999999999999999e-87  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.491604 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1748  NnrU  68.4 
 
 		 238 aa  319  1.9999999999999998e-86  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.493483  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0483  NnrUfamily protein  66.52 
 
 		 257 aa  318  3.9999999999999996e-86  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.398718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0470  NnrUfamily protein  66.52 
 
 		 257 aa  317  7e-86  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0147  NnrUfamily protein  70.22 
 
 		 238 aa  316  2e-85  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0460  NnrUfamily protein  66.81 
 
 		 238 aa  315  4e-85  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3165  NnrUfamily protein  65.69 
 
 		 240 aa  310  1e-83  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_26691  hypothetical protein  61.95 
 
 		 278 aa  305  4.0000000000000004e-82  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2399  hypothetical protein  62.78 
 
 		 243 aa  303  2.0000000000000002e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0294  hypothetical protein  64.62 
 
 		 243 aa  297  1e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1514  hypothetical protein  57.02 
 
 		 248 aa  279  3e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_01631  hypothetical protein  59.55 
 
 		 245 aa  278  5e-74  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.763625  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02201  hypothetical protein  56.14 
 
 		 248 aa  276  1e-73  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.348814  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01651  hypothetical protein  57.87 
 
 		 242 aa  264  7e-70  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01761  hypothetical protein  56.56 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.555031  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0150  hypothetical protein  56.94 
 
 		 242 aa  263  2e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01671  hypothetical protein  56.48 
 
 		 242 aa  261  6.999999999999999e-69  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_16955  predicted protein  57.96 
 
 		 231 aa  257  1e-67  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3577  NnrU family protein  30.57 
 
 		 234 aa  59.7  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0744833  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0498  hypothetical protein  29.93 
 
 		 226 aa  50.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2577  NnrU family protein  32.58 
 
 		 230 aa  49.3  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0822572  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0957  NnrU  26.95 
 
 		 233 aa  49.3  0.00006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3443  NnrU family protein  35.37 
 
 		 229 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.276248  decreased coverage  0.000167017 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2109  NnrUfamily protein  29.29 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.262467  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6222  denitrification regulatory protein  26.56 
 
 		 237 aa  44.7  0.001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.760958  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6294  NnrU family protein  27.16 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1234  NnrU  28.57 
 
 		 238 aa  43.9  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.137304  hitchhiker  0.000000439866 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>