25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1950 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1950  hypothetical protein  100 
 
 
249 aa  500  1e-141  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0380  hypothetical protein  68.95 
 
 
249 aa  328  3e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_22981  phosphatase  56.42 
 
 
258 aa  261  1e-68  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20061  phosphatases  45.77 
 
 
259 aa  229  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.235525  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1132  HAD family phosphatase  44.57 
 
 
259 aa  225  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16801  hypothetical protein  45.53 
 
 
258 aa  218  7.999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17681  phosphatases  33.6 
 
 
258 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.265006  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1653  hypothetical protein  32.95 
 
 
260 aa  164  2.0000000000000002e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.428173  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17521  phosphatase  34.02 
 
 
258 aa  162  6e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17431  phosphatase  32.52 
 
 
258 aa  152  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.196144  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3995  hypothetical protein  34.94 
 
 
269 aa  120  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.823867  hitchhiker  0.00000204012 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0627  hypothetical protein  33.74 
 
 
254 aa  113  2.0000000000000002e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.131401  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1833  hypothetical protein  32.17 
 
 
261 aa  111  8.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2614  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.46 
 
 
268 aa  105  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0296969 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0782  hypothetical protein  30.23 
 
 
266 aa  103  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0144057  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3964  hypothetical protein  27.67 
 
 
261 aa  97.4  2e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27056  predicted protein  29.62 
 
 
274 aa  86.7  4e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.496762  hitchhiker  0.000240324 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0406  hypothetical protein  29.57 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0416  hypothetical protein  29.57 
 
 
262 aa  83.2  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.306118  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2834  HAD family hydrolase  24.12 
 
 
224 aa  46.6  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.46316  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1574  phosphoglycolate phosphatase  29.01 
 
 
227 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0357575  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0975  phosphoglycolate phosphatase  26.06 
 
 
234 aa  43.9  0.003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.190554  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2080  phosphoglycolate phosphatase  27.61 
 
 
237 aa  43.1  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.307061  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4610  phosphoglycolate phosphatase  24.84 
 
 
272 aa  42.4  0.008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1008  phosphoglycolate phosphatase  26.06 
 
 
234 aa  42  0.009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>