36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_1485 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007513  Syncc9902_1485  hypothetical protein  100 
 
 		 237 aa  473  1e-132  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.868735  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0923  hypothetical protein  71.93 
 
 		 242 aa  332  4e-90  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.581577 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19221  hypothetical protein  52.27 
 
 		 264 aa  226  3e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.774034 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0413  Ion transport 2 domain-containing protein  31.58 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0647  ion transport family protein  31.93 
 
 		 247 aa  62.8  0.000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.861357  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06642  Kef-type K+ transport system NAD-binding component  27.84 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4607  hypothetical protein  31.2 
 
 		 249 aa  62  0.000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001142  potassium channel protein  24.49 
 
 		 228 aa  57.4  0.0000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1842  Ion transport 2 domain-containing protein  28.95 
 
 		 208 aa  57.8  0.0000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2411  Ion transport 2 domain protein  28.8 
 
 		 271 aa  55.8  0.0000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.403469  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1233  hypothetical protein  25.56 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0271776 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1772  Ion transport 2 domain-containing protein  30.95 
 
 		 211 aa  55.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2859  Ion transport 2 domain protein  30.23 
 
 		 219 aa  53.9  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4778  hypothetical protein  33.64 
 
 		 214 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.248369  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1459  Ion transport 2 domain-containing protein  30.77 
 
 		 247 aa  52  0.000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00209929 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0255  ion transport 2 domain-containing protein  29.91 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.106172 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1907  putative ion channel  28.32 
 
 		 220 aa  50.8  0.00002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5186  putative Voltage-gated potassium channel  29.56 
 
 		 229 aa  50.1  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.240486 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_54680  hypothetical protein  32.99 
 
 		 102 aa  49.7  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.238288  hitchhiker  0.00000298461 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3632  Ion transport 2 domain protein  26.21 
 
 		 222 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.070187  normal  0.750073 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0517  Ion transport 2 domain protein  27.97 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000756398  decreased coverage  0.0000000851094 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0500  Ion transport 2 domain protein  27.97 
 
 		 218 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2482  Ion transport 2 domain protein  24.41 
 
 		 227 aa  47.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.745368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1087  voltage-gated potassium channel  40.98 
 
 		 391 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3564  voltage-gated potassium channel  40.98 
 
 		 391 aa  47  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00301941  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1141  voltage-gated potassium channel  40.98 
 
 		 391 aa  47  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.378703  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3734  hypothetical protein  26 
 
 		 235 aa  47.4  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.724435 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0760  Ion transport 2 domain protein  34.78 
 
 		 224 aa  47  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.400355  normal  0.266865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2018  Ion transport 2 domain protein  23.96 
 
 		 231 aa  47  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2231  Ion transport 2 domain protein  30.93 
 
 		 234 aa  45.1  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.338612 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1489  Ion transport 2 domain protein  24.03 
 
 		 262 aa  44.7  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.670111  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1808  Ion transport 2 domain-containing protein  30.48 
 
 		 228 aa  43.9  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0516361  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3382  Ion transport protein  40.62 
 
 		 277 aa  43.1  0.004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0078085  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2780  Ion transport protein  39.62 
 
 		 284 aa  42.4  0.007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.715663  normal  0.450959 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1590  Ion transport protein  23.84 
 
 		 276 aa  42  0.008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1592  Ion transport protein  35.21 
 
 		 274 aa  42  0.008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0101925  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>