30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0167 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0167  hypothetical protein  100 
 
 
345 aa  693    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.13729 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0197  hypothetical protein  67.63 
 
 
354 aa  475  1e-133  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.759361  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25681  hypothetical protein  62.39 
 
 
366 aa  381  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0481  hypothetical protein  42.73 
 
 
333 aa  269  5e-71  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.118255 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3944  hypothetical protein  46.96 
 
 
329 aa  266  5e-70  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000347663  normal  0.0198473 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3894  glycosyl transferase, group 1  46.6 
 
 
329 aa  265  5.999999999999999e-70  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2034  hypothetical protein  42.56 
 
 
331 aa  264  2e-69  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.113453  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5868  glycosyl transferase group 1  29.5 
 
 
420 aa  47.4  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3258  glycosyl transferase group 1  34.55 
 
 
391 aa  46.2  0.0009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.190171  normal  0.151939 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1073  glycosyl transferase, group 1  27.1 
 
 
1261 aa  45.4  0.001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.328377  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0347  glycosyl transferase group 1  63.33 
 
 
369 aa  45.4  0.001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1374  glycosyl transferase group 1  41.3 
 
 
615 aa  45.8  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0108808  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3712  putative glycosyl transferases group 1 protein  34.21 
 
 
419 aa  44.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1061  glycosyltransferase  35.48 
 
 
350 aa  45.1  0.002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0357  glycosyl transferase, group 1  30.12 
 
 
389 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.137349  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0758  glycosyl transferase group 1  35.79 
 
 
1028 aa  43.9  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0491  glycosyl transferase, group 1  45.24 
 
 
381 aa  43.9  0.004  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1159  glycosyl transferase group 1  40 
 
 
1398 aa  43.9  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0412511  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3776  glycosyl transferase, group 1  45.83 
 
 
371 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0286  glycosyl transferase group 1  30.21 
 
 
384 aa  43.5  0.005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0910  glycosyl transferase group 1  34.21 
 
 
417 aa  43.5  0.006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0424  glycosyl transferase, group 1  34 
 
 
380 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132418  normal  0.166856 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3583  glycosyl transferase, group 1  45.28 
 
 
408 aa  43.1  0.007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4271  glycosyl transferase group 1  43.4 
 
 
400 aa  43.1  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.614702 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0394  glycosyl transferase group 1  39.71 
 
 
374 aa  42.7  0.008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.538009  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2487  putative mannosyltransferase  40 
 
 
381 aa  42.7  0.009  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0329082  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2139  glycosyl transferase group 1  27.36 
 
 
357 aa  42.7  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1473  hypothetical protein  41.79 
 
 
383 aa  42.7  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.574733  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2197  glycosyltransferase  40 
 
 
381 aa  42.7  0.01  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.122722  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2752  glycosyl transferase group 1  35.71 
 
 
435 aa  42.7  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.904634  hitchhiker  0.000312196 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>