18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4836 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010506  Swoo_4836  hypothetical protein  100 
 
 
222 aa  451  1.0000000000000001e-126  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4162  hypothetical protein  60 
 
 
220 aa  252  2.0000000000000002e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4444  hypothetical protein  58.17 
 
 
208 aa  239  2.9999999999999997e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3754  hypothetical protein  52.04 
 
 
225 aa  198  5e-50  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0154539 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0110  hypothetical protein  53.16 
 
 
208 aa  198  5e-50  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.338724  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0114  hypothetical protein  53.26 
 
 
203 aa  197  7e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0118  hypothetical protein  52.38 
 
 
208 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0119  hypothetical protein  52.38 
 
 
208 aa  192  3e-48  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0114  hypothetical protein  51.85 
 
 
208 aa  192  5e-48  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4240  hypothetical protein  51.32 
 
 
208 aa  190  2e-47  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0115  hypothetical protein  53.48 
 
 
206 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.651645 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0110  hypothetical protein  53.48 
 
 
206 aa  181  8.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0115  hypothetical protein  50.52 
 
 
213 aa  181  1e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0368167 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0085  hypothetical protein  44.2 
 
 
174 aa  150  1e-35  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.352391  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3611  hypothetical protein  40 
 
 
229 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00237944  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002052  hypothetical protein  35.26 
 
 
194 aa  85.1  9e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00396  hypothetical protein  31.02 
 
 
211 aa  69.7  0.00000000004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2478  hypothetical protein  32 
 
 
218 aa  65.5  0.0000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>