37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4578 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4578  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 355 aa  739    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000313167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0339  aminoglycoside phosphotransferase  78.31 
 
 		 358 aa  588  1e-167  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0356  aminoglycoside phosphotransferase  74.58 
 
 		 354 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0358  aminoglycoside phosphotransferase  74.29 
 
 		 354 aa  551  1e-156  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0363  aminoglycoside phosphotransferase  74.58 
 
 		 354 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0366  aminoglycoside phosphotransferase  74.58 
 
 		 354 aa  553  1e-156  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3627  aminoglycoside phosphotransferase  73.73 
 
 		 365 aa  543  1e-153  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0364  hypothetical protein  72.83 
 
 		 346 aa  528  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3610  aminoglycoside phosphotransferase  73.73 
 
 		 354 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0333  aminoglycoside phosphotransferase  73.73 
 
 		 354 aa  528  1e-149  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.320004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3807  aminoglycoside phosphotransferase  73.45 
 
 		 354 aa  530  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3874  aminoglycoside phosphotransferase  70.99 
 
 		 355 aa  524  1e-148  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3494  aminoglycoside phosphotransferase  69.86 
 
 		 354 aa  509  1e-143  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.794585 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0269  hypothetical protein  65.71 
 
 		 354 aa  475  1e-133  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0367  aminoglycoside phosphotransferase  55.21 
 
 		 356 aa  411  1e-114  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3431  aminoglycoside phosphotransferase  46.87 
 
 		 402 aa  324  2e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0655  hypothetical protein  38.37 
 
 		 361 aa  238  2e-61  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7005  aminoglycoside phosphotransferase  36.31 
 
 		 348 aa  225  8e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000158499  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0729  aminoglycoside phosphotransferase  37.57 
 
 		 385 aa  225  9e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.272999 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2100  aminoglycoside phosphotransferase  35.76 
 
 		 382 aa  218  1e-55  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.624576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1410  MdsC protein  35.38 
 
 		 368 aa  217  2e-55  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.280569  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1518  aminoglycoside phosphotransferase  36.63 
 
 		 347 aa  216  4e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.215036  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2269  aminoglycoside phosphotransferase  34.49 
 
 		 352 aa  211  1e-53  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.788221  normal  0.0258017 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0030  hypothetical protein  36.23 
 
 		 364 aa  209  7e-53  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0570  hypothetical protein  34.22 
 
 		 370 aa  194  1e-48  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0868  hypothetical protein  35.52 
 
 		 365 aa  190  4e-47  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.877924  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1766  putative homoserine kinase type II  33.23 
 
 		 359 aa  189  5e-47  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13281  hypothetical protein  32.56 
 
 		 371 aa  175  9.999999999999999e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1142  aminoglycoside phosphotransferase  32.46 
 
 		 372 aa  173  5e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655934  normal  0.0113624 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1795  hypothetical protein  32.85 
 
 		 376 aa  170  4e-41  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156742  normal  0.0804022 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3260  aminoglycoside phosphotransferase  27.86 
 
 		 382 aa  162  8.000000000000001e-39  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0860  hypothetical protein  30.14 
 
 		 372 aa  154  2e-36  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.350344  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07491  hypothetical protein  29.86 
 
 		 384 aa  142  9e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193823  normal  0.063089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0081  hypothetical protein  25.78 
 
 		 387 aa  109  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.201712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5808  aminoglycoside phosphotransferase  28.91 
 
 		 356 aa  102  9e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07051  hypothetical protein  27.41 
 
 		 273 aa  83.6  0.000000000000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_33361  protein serine/threonine kinase activity  27.5 
 
 		 408 aa  43.5  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.814262 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>