37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3494 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3494  aminoglycoside phosphotransferase  100 
 
 		 354 aa  733    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.794585 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0339  aminoglycoside phosphotransferase  72.6 
 
 		 358 aa  541  1e-153  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3874  aminoglycoside phosphotransferase  71.83 
 
 		 355 aa  521  1e-147  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0356  aminoglycoside phosphotransferase  70.62 
 
 		 354 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0358  aminoglycoside phosphotransferase  70.9 
 
 		 354 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3627  aminoglycoside phosphotransferase  71.02 
 
 		 365 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0363  aminoglycoside phosphotransferase  70.62 
 
 		 354 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0366  aminoglycoside phosphotransferase  70.62 
 
 		 354 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4578  aminoglycoside phosphotransferase  69.86 
 
 		 355 aa  509  1e-143  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000313167 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3807  aminoglycoside phosphotransferase  70.34 
 
 		 354 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3610  aminoglycoside phosphotransferase  70.45 
 
 		 354 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0333  aminoglycoside phosphotransferase  70.45 
 
 		 354 aa  503  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.320004 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0364  hypothetical protein  69.48 
 
 		 346 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0269  hypothetical protein  68.38 
 
 		 354 aa  486  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0367  aminoglycoside phosphotransferase  56 
 
 		 356 aa  409  1e-113  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3431  aminoglycoside phosphotransferase  48.96 
 
 		 402 aa  346  3e-94  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0655  hypothetical protein  43.03 
 
 		 361 aa  270  2e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0030  hypothetical protein  37.13 
 
 		 364 aa  229  5e-59  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0729  aminoglycoside phosphotransferase  35.24 
 
 		 385 aa  226  4e-58  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.272999 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2100  aminoglycoside phosphotransferase  37.5 
 
 		 382 aa  225  1e-57  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.624576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1410  MdsC protein  35.12 
 
 		 368 aa  224  2e-57  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.280569  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7005  aminoglycoside phosphotransferase  35.26 
 
 		 348 aa  219  7e-56  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000158499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1518  aminoglycoside phosphotransferase  34.91 
 
 		 347 aa  212  7.999999999999999e-54  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.215036  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2269  aminoglycoside phosphotransferase  33.05 
 
 		 352 aa  203  5e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.788221  normal  0.0258017 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1766  putative homoserine kinase type II  34.2 
 
 		 359 aa  202  8e-51  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0570  hypothetical protein  34.73 
 
 		 370 aa  200  3e-50  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3260  aminoglycoside phosphotransferase  31.43 
 
 		 382 aa  190  2.9999999999999997e-47  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1795  hypothetical protein  33.15 
 
 		 376 aa  176  7e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156742  normal  0.0804022 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0868  hypothetical protein  33.63 
 
 		 365 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.877924  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13281  hypothetical protein  32.01 
 
 		 371 aa  172  5.999999999999999e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1142  aminoglycoside phosphotransferase  31.98 
 
 		 372 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655934  normal  0.0113624 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0860  hypothetical protein  29.16 
 
 		 372 aa  155  7e-37  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.350344  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07491  hypothetical protein  27.52 
 
 		 384 aa  123  4e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193823  normal  0.063089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0081  hypothetical protein  26.59 
 
 		 387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.201712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5808  aminoglycoside phosphotransferase  29.11 
 
 		 356 aa  98.6  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07051  hypothetical protein  27.8 
 
 		 273 aa  88.6  1e-16  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1388  aminoglycoside phosphotransferase  31.9 
 
 		 411 aa  47  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.450425  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>