36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0655 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0655  hypothetical protein  100 
 
 		 361 aa  748    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3627  aminoglycoside phosphotransferase  43.98 
 
 		 365 aa  284  2.0000000000000002e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0364  hypothetical protein  42.98 
 
 		 346 aa  283  3.0000000000000004e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0358  aminoglycoside phosphotransferase  43.44 
 
 		 354 aa  283  4.0000000000000003e-75  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0366  aminoglycoside phosphotransferase  43.44 
 
 		 354 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0363  aminoglycoside phosphotransferase  43.44 
 
 		 354 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0356  aminoglycoside phosphotransferase  43.44 
 
 		 354 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3610  aminoglycoside phosphotransferase  43.44 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0333  aminoglycoside phosphotransferase  43.44 
 
 		 354 aa  278  1e-73  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.320004 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3807  aminoglycoside phosphotransferase  43.15 
 
 		 354 aa  277  3e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0339  aminoglycoside phosphotransferase  40.52 
 
 		 358 aa  265  7e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3494  aminoglycoside phosphotransferase  43.03 
 
 		 354 aa  261  1e-68  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.794585 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3874  aminoglycoside phosphotransferase  37.95 
 
 		 355 aa  257  2e-67  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0367  aminoglycoside phosphotransferase  40 
 
 		 356 aa  256  5e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3431  aminoglycoside phosphotransferase  41.54 
 
 		 402 aa  252  7e-66  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0269  hypothetical protein  40.06 
 
 		 354 aa  241  1e-62  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4578  aminoglycoside phosphotransferase  38.37 
 
 		 355 aa  225  9e-58  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000313167 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0030  hypothetical protein  35.19 
 
 		 364 aa  206  7e-52  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2100  aminoglycoside phosphotransferase  33.23 
 
 		 382 aa  197  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.624576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1410  MdsC protein  34.83 
 
 		 368 aa  196  4.0000000000000005e-49  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.280569  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0729  aminoglycoside phosphotransferase  34.77 
 
 		 385 aa  194  2e-48  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.272999 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7005  aminoglycoside phosphotransferase  31.42 
 
 		 348 aa  185  1.0000000000000001e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000158499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1518  aminoglycoside phosphotransferase  34.53 
 
 		 347 aa  183  3e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.215036  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1766  putative homoserine kinase type II  32.73 
 
 		 359 aa  182  7e-45  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0570  hypothetical protein  33.74 
 
 		 370 aa  179  5.999999999999999e-44  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2269  aminoglycoside phosphotransferase  31.53 
 
 		 352 aa  169  6e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.788221  normal  0.0258017 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0868  hypothetical protein  30.43 
 
 		 365 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.877924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3260  aminoglycoside phosphotransferase  27.41 
 
 		 382 aa  143  4e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1142  aminoglycoside phosphotransferase  27.19 
 
 		 372 aa  141  1.9999999999999998e-32  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655934  normal  0.0113624 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1795  hypothetical protein  27.74 
 
 		 376 aa  140  3.9999999999999997e-32  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156742  normal  0.0804022 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13281  hypothetical protein  29.5 
 
 		 371 aa  131  2.0000000000000002e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07491  hypothetical protein  28.74 
 
 		 384 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193823  normal  0.063089 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0860  hypothetical protein  26.21 
 
 		 372 aa  129  5.0000000000000004e-29  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.350344  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5808  aminoglycoside phosphotransferase  25.84 
 
 		 356 aa  105  9e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451965  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0081  hypothetical protein  25.63 
 
 		 387 aa  95.1  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.201712  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07051  hypothetical protein  27.09 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>