40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPF_1410 on replicon NC_008261
Organism: Clostridium perfringens ATCC 13124



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008261  CPF_1410  MdsC protein  100 
 
 		 368 aa  755    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.280569  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0570  hypothetical protein  54.6 
 
 		 370 aa  398  1e-109  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.167772  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0030  hypothetical protein  46.7 
 
 		 364 aa  354  2e-96  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.549525 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0729  aminoglycoside phosphotransferase  42.13 
 
 		 385 aa  309  5e-83  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.272999 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1766  putative homoserine kinase type II  43.82 
 
 		 359 aa  307  2.0000000000000002e-82  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2100  aminoglycoside phosphotransferase  40.06 
 
 		 382 aa  291  2e-77  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.624576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0366  aminoglycoside phosphotransferase  34.2 
 
 		 354 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000090476 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0363  aminoglycoside phosphotransferase  34.2 
 
 		 354 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0356  aminoglycoside phosphotransferase  34.2 
 
 		 354 aa  228  9e-59  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0358  aminoglycoside phosphotransferase  34.2 
 
 		 354 aa  228  1e-58  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1142  aminoglycoside phosphotransferase  34.07 
 
 		 372 aa  226  4e-58  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.655934  normal  0.0113624 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0364  hypothetical protein  35.03 
 
 		 346 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0339  aminoglycoside phosphotransferase  35.69 
 
 		 358 aa  226  7e-58  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0269  hypothetical protein  34.36 
 
 		 354 aa  225  1e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3874  aminoglycoside phosphotransferase  34.52 
 
 		 355 aa  224  2e-57  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3627  aminoglycoside phosphotransferase  34.86 
 
 		 365 aa  223  3e-57  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0333  aminoglycoside phosphotransferase  33.99 
 
 		 354 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.320004 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3610  aminoglycoside phosphotransferase  33.99 
 
 		 354 aa  223  6e-57  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3260  aminoglycoside phosphotransferase  32.12 
 
 		 382 aa  221  1.9999999999999999e-56  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3807  aminoglycoside phosphotransferase  33.43 
 
 		 354 aa  219  8.999999999999998e-56  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1518  aminoglycoside phosphotransferase  35.52 
 
 		 347 aa  218  8.999999999999998e-56  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.215036  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1795  hypothetical protein  32.61 
 
 		 376 aa  219  8.999999999999998e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.156742  normal  0.0804022 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3494  aminoglycoside phosphotransferase  35.12 
 
 		 354 aa  215  9.999999999999999e-55  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.794585 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_13281  hypothetical protein  33.42 
 
 		 371 aa  213  2.9999999999999995e-54  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.8356 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0860  hypothetical protein  32.79 
 
 		 372 aa  211  1e-53  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.350344  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4578  aminoglycoside phosphotransferase  35.38 
 
 		 355 aa  206  7e-52  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000313167 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0868  hypothetical protein  31.37 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.877924  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0367  aminoglycoside phosphotransferase  32.29 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0655  hypothetical protein  34.83 
 
 		 361 aa  196  4.0000000000000005e-49  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.882073  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7005  aminoglycoside phosphotransferase  30.56 
 
 		 348 aa  196  6e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000158499  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2269  aminoglycoside phosphotransferase  31.27 
 
 		 352 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.788221  normal  0.0258017 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3431  aminoglycoside phosphotransferase  31.14 
 
 		 402 aa  183  4.0000000000000006e-45  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07491  hypothetical protein  28.53 
 
 		 384 aa  156  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.193823  normal  0.063089 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0081  hypothetical protein  30.03 
 
 		 387 aa  139  8.999999999999999e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.201712  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07051  hypothetical protein  28.85 
 
 		 273 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.134366  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1221  hypothetical protein  91.67 
 
 		 48 aa  95.5  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.432055  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5808  aminoglycoside phosphotransferase  23.45 
 
 		 356 aa  95.1  2e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.451965  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1220  hypothetical protein  100 
 
 		 33 aa  67  0.0000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.417449  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1956  aminoglycoside phosphotransferase  23.08 
 
 		 345 aa  52.4  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.92621  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0311  putative aminotransferase protein  22.65 
 
 		 371 aa  51.2  0.00003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.452775  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>