31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_0932 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_0813  hypothetical protein  73.36 
 
 
474 aa  675    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00191266 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3058  hypothetical protein  71.65 
 
 
473 aa  669    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0797  hypothetical protein  73.93 
 
 
472 aa  709    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0864  hypothetical protein  69.98 
 
 
481 aa  681    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3313  hypothetical protein  70.7 
 
 
474 aa  659    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3210  hypothetical protein  73.14 
 
 
474 aa  671    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.846919 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3623  hypothetical protein  70.39 
 
 
481 aa  683    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.672371 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0932  hypothetical protein  100 
 
 
474 aa  967    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3500  hypothetical protein  70.19 
 
 
481 aa  682    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3428  hypothetical protein  69.98 
 
 
481 aa  681    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0750  hypothetical protein  73.58 
 
 
475 aa  659    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0975  hypothetical protein  70.91 
 
 
474 aa  665    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0833  hypothetical protein  82.77 
 
 
474 aa  794    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0626  hypothetical protein  72.1 
 
 
461 aa  618  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0312  hypothetical protein  57.24 
 
 
479 aa  520  1e-146  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000250033  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1779  hypothetical protein  39.35 
 
 
425 aa  303  3.0000000000000004e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.501115  normal  0.0869109 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0270  hypothetical protein  39.86 
 
 
417 aa  289  8e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1615  hypothetical protein  40.8 
 
 
425 aa  284  2.0000000000000002e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4013  hypothetical protein  40.68 
 
 
443 aa  267  2.9999999999999995e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.169231  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4105  hypothetical protein  38.37 
 
 
444 aa  251  2e-65  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2703  hypothetical protein  40.19 
 
 
443 aa  247  3e-64  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2787  hypothetical protein  32.02 
 
 
405 aa  181  2e-44  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.151152  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0130  glutaredoxin  31.3 
 
 
382 aa  167  4e-40  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2246  hypothetical protein  30.61 
 
 
409 aa  161  3e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.950411  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1633  glutaredoxin  22.57 
 
 
406 aa  103  7e-21  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0015407  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0778  hypothetical protein  21.16 
 
 
395 aa  80.5  0.00000000000006  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0807  hypothetical protein  21.16 
 
 
395 aa  79.7  0.0000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0073  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  31.38 
 
 
286 aa  72.8  0.00000000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3231  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.77 
 
 
379 aa  58.9  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0855  cytochrome c biogenesis protein, transmembrane region  23.26 
 
 
373 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.399663  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0187  hypothetical protein  27.51 
 
 
377 aa  43.9  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>