14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4515 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4515  hypothetical protein  100 
 
 		 166 aa  323  6e-88  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0560805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0422  propeptide PepSY amd peptidase M4  33.75 
 
 		 173 aa  79  0.00000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1922  peptidase  28.48 
 
 		 167 aa  53.9  0.000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00193807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2497  peptidase  25.45 
 
 		 189 aa  50.1  0.00001  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1661  peptidase  43.08 
 
 		 104 aa  48.1  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5098  membrane protein  36.92 
 
 		 101 aa  44.3  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.447324  normal  0.150057 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2504  propeptide, PepSY amd peptidase M4  34.72 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.637039 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2110  hypothetical protein  34.72 
 
 		 111 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3432  Propeptide PepSY amd peptidase M4  40.35 
 
 		 105 aa  42.4  0.003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.476517  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0421  hypothetical protein  32.2 
 
 		 190 aa  41.6  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.306023  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0431  hypothetical protein  32.2 
 
 		 190 aa  41.6  0.005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.534709  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2346  hypothetical protein  39.44 
 
 		 104 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000250595 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3350  peptidase  39.44 
 
 		 104 aa  40.8  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1786  peptidase  39.44 
 
 		 104 aa  40.4  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.106224  normal  0.0469804 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>