16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3571 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3571  hypothetical protein  100 
 
 		 337 aa  646    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.487226 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1372  hypothetical protein  52.08 
 
 		 338 aa  275  8e-73  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.119661  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0595  hypothetical protein  38.57 
 
 		 370 aa  187  2e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.28067 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0709  hypothetical protein  37.97 
 
 		 372 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0101  hypothetical protein  40.51 
 
 		 366 aa  177  3e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.867237  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3101  hypothetical protein  39.47 
 
 		 382 aa  174  2.9999999999999996e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.773586  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1539  hypothetical protein  35.98 
 
 		 377 aa  171  1e-41  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2550  hypothetical protein  39.09 
 
 		 372 aa  170  4e-41  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0136518 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2498  hypothetical protein  39.13 
 
 		 363 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1212  hypothetical protein  32.31 
 
 		 378 aa  150  3e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2446  hypothetical protein  34.69 
 
 		 364 aa  147  3e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.011853  normal  0.936007 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1427  hypothetical protein  40.62 
 
 		 367 aa  140  3.9999999999999997e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.617063  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01319  hypothetical protein  25.36 
 
 		 361 aa  114  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.436322  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4324  hypothetical protein  26.07 
 
 		 328 aa  60.1  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.404094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3382  hypothetical protein  23.83 
 
 		 395 aa  50.8  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.127252  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3377  hypothetical protein  29.79 
 
 		 363 aa  43.5  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.718952  normal  0.0514733 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>