20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_1811 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_1811  polysaccharide deacetylase  100 
 
 		 249 aa  478  1e-134  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1223  hypothetical protein  32.67 
 
 		 258 aa  86.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4354  hypothetical protein  32.56 
 
 		 254 aa  86.7  3e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00552535  normal  0.0179088 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1140  deacetylase-like protein  26.36 
 
 		 229 aa  83.6  0.000000000000003  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4879  hypothetical protein  31.96 
 
 		 253 aa  82.8  0.000000000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.222084  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_17920  hypothetical protein  30.88 
 
 		 255 aa  81.3  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00986232  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1369  hypothetical protein  31.3 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.271158 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4445  hypothetical protein  31.82 
 
 		 254 aa  77.8  0.0000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.00317047  hitchhiker  0.000033336 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1009  putative deacetylase  29.72 
 
 		 254 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00774779  hitchhiker  0.00000000000895825 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56040  hypothetical protein  30.84 
 
 		 253 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0696  deacetylase-like protein  26.85 
 
 		 244 aa  71.6  0.00000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4433  hypothetical protein  30.33 
 
 		 258 aa  66.6  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.323025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3884  hypothetical protein  28.69 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3772  hypothetical protein  28.69 
 
 		 264 aa  67  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.516985  normal  0.0626785 
 
 
-
 
NC_003296  RS02231  hypothetical protein  29.46 
 
 		 261 aa  62.4  0.000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3284  putative deacetylase  29.84 
 
 		 250 aa  56.6  0.0000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3616  hypothetical protein  32.12 
 
 		 232 aa  47.4  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.689056  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2045  polysaccharide deacetylase  24.79 
 
 		 481 aa  46.6  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0530  hypothetical protein  17.81 
 
 		 266 aa  44.3  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1389  hypothetical protein  24.64 
 
 		 266 aa  43.1  0.005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>