26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_37680 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_37680  hypothetical protein  100 
 
 		 270 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0858561 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6825  hypothetical protein  37.4 
 
 		 268 aa  165  9e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5098  hypothetical protein  30.08 
 
 		 265 aa  92.8  6e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4526  hypothetical protein  28.57 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4613  hypothetical protein  28.57 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4909  hypothetical protein  28.57 
 
 		 265 aa  88.6  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1649  hypothetical protein  28.46 
 
 		 265 aa  84.3  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10832  hypothetical protein  26.28 
 
 		 270 aa  73.6  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00174032 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0597  hypothetical protein  30.54 
 
 		 232 aa  70.5  0.00000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0455  hypothetical protein  26.24 
 
 		 226 aa  69.7  0.00000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.184475  normal  0.579054 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0897  hypothetical protein  23.85 
 
 		 226 aa  64.3  0.000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.870486  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2361  hypothetical protein  26.73 
 
 		 247 aa  63.2  0.000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0463376  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4644  hypothetical protein  37.23 
 
 		 229 aa  62.8  0.000000005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2720  hypothetical protein  25.79 
 
 		 229 aa  60.5  0.00000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.025893  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6172  hypothetical protein  22.31 
 
 		 255 aa  58.2  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.16698 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8249  hypothetical protein  33.33 
 
 		 253 aa  58.5  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4353  hypothetical protein  24.08 
 
 		 232 aa  55.8  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.442825  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4985  hypothetical protein  32.41 
 
 		 241 aa  55.1  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0945  hypothetical protein  25.4 
 
 		 389 aa  51.6  0.00001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.085357  normal  0.205569 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6370  hypothetical protein  25.75 
 
 		 248 aa  51.2  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3546  hypothetical protein  24.25 
 
 		 275 aa  51.6  0.00002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.341161  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0849  hypothetical protein  27.18 
 
 		 230 aa  48.1  0.0001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0295  hypothetical protein  35.16 
 
 		 263 aa  45.1  0.001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2023  hypothetical protein  23.53 
 
 		 259 aa  44.3  0.002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3896  hypothetical protein  28 
 
 		 405 aa  43.9  0.003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.103005 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0339  hypothetical protein  34.07 
 
 		 262 aa  42  0.009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.467324  normal  0.025652 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>