More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_35030 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_35030  tRNA-Thr  100 
 
 		 73 bp  145  2e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.838574  normal  0.836072 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1579  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1614  tRNA-Thr  96.43 
 
 		 73 bp  95.6  1e-18  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.614815 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0037  tRNA-Thr  90.91 
 
 		 76 bp  83.8  0.000000000000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5653  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.0000242267  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5662  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000000864801  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5690  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000246969  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5716  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0824235  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5735a  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0302849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5803  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.0081474  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000021981  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000539479  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00313762  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000455274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000106689  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000240794  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000772108  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  1.30826e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Lys-6  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000899771  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000316756  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000759811  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000000000525379  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000187971  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 79 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000712241  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5018  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00214823  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0781  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.66086e-30 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5654  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000664356  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000787215  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000045502  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-3  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146093  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-4  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.067054  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Lys-5  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00169345  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5656  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000763421  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0039  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000453984  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0275  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0020  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00467445  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0048  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 73 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000535943  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0173  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0567172 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0123  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0178168  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0096  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000250387  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0097  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00156576  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4987  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0194  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000250761  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5833  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00233495  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0856  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000473646  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0297  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000294732  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5576  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 78 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.5317200000000003e-28 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0148  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000555298  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5728  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000897911  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5635  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.112483  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5670  tRNA-Lys  92.86 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000995233  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET_tRNA-Lys-2  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 73 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.047659  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_03880  tRNA-Thr  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.0309562 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_778  tRNA-Lys  91.38 
 
 		 76 bp  75.8  0.000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0028  tRNA-Lys  92.45 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0127265  normal  0.289894 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t13  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_R0009  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000774106  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0020  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000489329  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0049  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 76 bp  73.8  0.000000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_R0015  tRNA-Lys  91.23 
 
 		 73 bp  73.8  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0122197  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0059  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0228  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000829583  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Thr-1  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Thr-2  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0264788  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Thr-4  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5046  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000000244729  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0020  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0111108  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0016  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0039  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.595409  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0077  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_R0029  tRNA-Thr  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0047  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000113586  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5142  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000365086  normal  0.814719 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5342  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 78 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000000164653  hitchhiker  0.0000000000098497 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_R0033  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0127  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.615577  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0049  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00000206578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0152  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000001938  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0100  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000113325  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_R0053  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.128402  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0027  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00584174  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0176  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_t0417  tRNA-Thr  87.5 
 
 		 73 bp  71.9  0.00000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00804447  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4575  tRNA-Lys  91.07 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.0000000000569223  normal  0.0806914 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0031  tRNA-Trp  88.89 
 
 		 76 bp  69.9  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_R0052  tRNA-Thr  89.66 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.040302  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0057  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.102505  normal  0.0559478 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0056  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.102951  normal  0.0568899 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0058  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.108577  normal  0.0554594 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_R0059  tRNA-Thr  95.24 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.105531  normal  0.0549747 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_6048  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.019189  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_R0021  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0160361  normal  0.0210498 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_R0047  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0026  tRNA-Thr  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0427282  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_R0016  tRNA-Lys  89.47 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000293232  hitchhiker  0.00358578 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Lys-1  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0000645959  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0019  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00557202  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0039  tRNA-Lys  89.29 
 
 		 73 bp  63.9  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.163516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>