More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_22330 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_22330  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  100 
 
 
255 aa  513  1.0000000000000001e-145  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.025585  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2181  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  82.68 
 
 
255 aa  419  1e-116  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5937  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  70.24 
 
 
254 aa  374  1e-103  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  hitchhiker  0.00491026 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3250  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  71.26 
 
 
255 aa  371  1e-102  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.84764 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  69.84 
 
 
254 aa  370  1e-102  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.112632  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2302  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  71.94 
 
 
270 aa  371  1e-102  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00925959  hitchhiker  0.00103647 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2497  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  70.08 
 
 
260 aa  370  1e-101  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3024  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  70.47 
 
 
255 aa  367  1e-100  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.662396  normal  0.850355 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1165  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  66.4 
 
 
255 aa  346  2e-94  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.806764 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1842  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  65.48 
 
 
254 aa  345  5e-94  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2278  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  64.98 
 
 
259 aa  340  2e-92  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000252771  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2302  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  65.35 
 
 
256 aa  337  9e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2226  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  64.84 
 
 
257 aa  337  9e-92  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.313635  decreased coverage  0.00565512 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2494  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.13 
 
 
269 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.916857  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2457  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.13 
 
 
269 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.640816  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2502  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.13 
 
 
269 aa  337  9e-92  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1894  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  66.02 
 
 
264 aa  336  1.9999999999999998e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0870843  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2777  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.1 
 
 
254 aa  334  9e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.622262 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1152  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  66.01 
 
 
255 aa  333  1e-90  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.542606  normal  0.345931 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1687  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  67.06 
 
 
255 aa  333  2e-90  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2321  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.78 
 
 
255 aa  331  6e-90  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.788907  normal  0.758579 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3657  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.92 
 
 
268 aa  330  1e-89  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.418184  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21770  Enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  63.39 
 
 
256 aa  328  7e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13510  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  61.96 
 
 
260 aa  326  2.0000000000000001e-88  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1417  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.14 
 
 
256 aa  325  5e-88  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.226975  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2572  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  63.67 
 
 
257 aa  325  6e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.215177  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11513  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  58.49 
 
 
269 aa  322  5e-87  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.209226 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2753  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  59.32 
 
 
269 aa  319  3e-86  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.142364 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4851  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  64.82 
 
 
254 aa  318  7e-86  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2105  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  60.63 
 
 
258 aa  314  9e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0848  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  63.9 
 
 
254 aa  309  2.9999999999999997e-83  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2408  Enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  59.47 
 
 
280 aa  298  7e-80  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2082  Enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  59.47 
 
 
279 aa  297  9e-80  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.37937  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0853  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.81 
 
 
259 aa  290  2e-77  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1232  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  55.69 
 
 
257 aa  286  2e-76  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.541624  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4156  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  57.48 
 
 
264 aa  281  9e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.255877 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4547  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  49.8 
 
 
255 aa  260  2e-68  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0812385 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4134  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  51.19 
 
 
256 aa  233  2.0000000000000002e-60  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1642  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.92 
 
 
260 aa  173  1.9999999999999998e-42  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.657325 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1426  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  40.77 
 
 
274 aa  172  5e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1734  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  40.16 
 
 
274 aa  172  5.999999999999999e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1399  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  39.37 
 
 
274 aa  169  5e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0780  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  40.39 
 
 
273 aa  167  1e-40  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00585388  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3406  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  41.18 
 
 
259 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  39 
 
 
255 aa  166  2e-40  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1555  enoyl-(acyl-carrier-protein)-like protein  41.41 
 
 
259 aa  167  2e-40  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0980  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  41.09 
 
 
265 aa  167  2e-40  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1935  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  40.39 
 
 
265 aa  163  3e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0125634  normal  0.0651157 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1172  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  39.38 
 
 
264 aa  160  2e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00253599  normal  0.521037 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1977  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.37 
 
 
263 aa  160  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00240777  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1587  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.58 
 
 
274 aa  159  3e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0818628  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1608  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.37 
 
 
263 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0152673  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3203  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.37 
 
 
263 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0582319  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2636  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.37 
 
 
263 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.706352  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0513  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  40.16 
 
 
272 aa  159  3e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.882519  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1384  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.37 
 
 
263 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.154023  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2111  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.37 
 
 
263 aa  160  3e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.520882  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2548  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.37 
 
 
263 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2494  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.37 
 
 
263 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1698  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.91 
 
 
265 aa  159  4e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0638864 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1672  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  42.53 
 
 
284 aa  159  5e-38  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.106636 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0407  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  34.9 
 
 
255 aa  159  5e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.369789  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1635  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.98 
 
 
263 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.212649  normal  0.660532 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2130  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.46 
 
 
260 aa  157  1e-37  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.81879  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1384  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.65 
 
 
263 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0557222  normal  0.680475 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2147  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.31 
 
 
260 aa  157  2e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0274334  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2502  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.37 
 
 
263 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767739  hitchhiker  0.00423136 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0424  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
273 aa  156  3e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2643  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
265 aa  155  4e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.203215  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1107  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.84 
 
 
264 aa  155  5.0000000000000005e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.680719 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2127  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.38 
 
 
261 aa  154  9e-37  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.124717  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2740  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.5 
 
 
260 aa  154  1e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.296305  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1263  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.13 
 
 
260 aa  154  2e-36  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.00175995  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1821  hypothetical protein  38.67 
 
 
268 aa  152  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1820  hypothetical protein  38.67 
 
 
268 aa  153  2.9999999999999998e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0598  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.6 
 
 
263 aa  153  2.9999999999999998e-36  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1013  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.45 
 
 
264 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0613634  normal  0.0886164 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3255  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  37.31 
 
 
265 aa  152  5.9999999999999996e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2419  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase [NADH]  37.55 
 
 
265 aa  151  8e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1245  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.61 
 
 
273 aa  151  8.999999999999999e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.766036  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1028  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.3 
 
 
256 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.506161  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1009  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.3 
 
 
256 aa  150  2e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0262666  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1181  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.84 
 
 
258 aa  150  2e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242928  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0260  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  44.5 
 
 
261 aa  150  2e-35  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.18961  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2912  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.67 
 
 
255 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1033  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.61 
 
 
261 aa  149  5e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0420  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase  38.13 
 
 
257 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.629326  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0582  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.13 
 
 
257 aa  149  6e-35  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.578692  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2277  enoyl-[acyl-carrier-protein] reductase  37.21 
 
 
263 aa  148  7e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0981  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  35.69 
 
 
254 aa  146  2.0000000000000003e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000808  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1396  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0189577 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2814  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  39.23 
 
 
256 aa  146  3e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.486877  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1651  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  38.08 
 
 
262 aa  146  3e-34  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.627709  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1751  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  36.86 
 
 
273 aa  146  4.0000000000000006e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0464231  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2018  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.07 
 
 
265 aa  145  7.0000000000000006e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0601  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  37.7 
 
 
256 aa  145  8.000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.356019  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0903  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  37.55 
 
 
257 aa  144  9e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2044  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH-dependent)  37.94 
 
 
255 aa  144  1e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.7605800000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1585  enoyl-(acyl-carrier-protein) reductase (NADH)  34.5 
 
 
260 aa  144  1e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000090122  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44040  enoyl-(acyl carrier protein) reductase  38.65 
 
 
260 aa  144  1e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>