25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_20050 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_20050  hypothetical protein  100 
 
 		 75 aa  154  3e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408374  hitchhiker  0.00194499 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3527  hypothetical protein  54.93 
 
 		 76 aa  86.7  9e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2436  hypothetical protein  60.71 
 
 		 93 aa  74.3  0.0000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2315  hypothetical protein  61.54 
 
 		 75 aa  71.2  0.000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.626905  hitchhiker  0.00521659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2161  hypothetical protein  63.04 
 
 		 75 aa  67  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3161  hypothetical protein  45.61 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.738065  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3223  hypothetical protein  45.61 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.245573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3173  hypothetical protein  45.61 
 
 		 83 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2771  hypothetical protein  46.15 
 
 		 103 aa  63.9  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00046183  hitchhiker  0.000158734 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2656  hypothetical protein  47.62 
 
 		 72 aa  63.2  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2654  hypothetical protein  50.88 
 
 		 80 aa  62  0.000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00923338  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2131  hypothetical protein  53.23 
 
 		 84 aa  57.8  0.00000006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.232195  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3040  hypothetical protein  53.49 
 
 		 79 aa  55.8  0.0000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.754474 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3486  hypothetical protein  46.38 
 
 		 88 aa  55.5  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0203743  normal  0.534669 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4901  hypothetical protein  48.94 
 
 		 67 aa  53.1  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342241  normal  0.0633468 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2785  hypothetical protein  43.14 
 
 		 61 aa  49.7  0.00001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.778108  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2014  hypothetical protein  43.14 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4546  hypothetical protein  43.14 
 
 		 61 aa  47.8  0.00005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16270  hypothetical protein  42.31 
 
 		 92 aa  47  0.00009  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.020473  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2652  hypothetical protein  46.51 
 
 		 67 aa  47  0.0001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441179  normal  0.0488909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9224  hypothetical protein  43.14 
 
 		 61 aa  45.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3470  hypothetical protein  41.18 
 
 		 61 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.599905  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1816  hypothetical protein  40 
 
 		 78 aa  43.5  0.0009  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.707667  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2252  hypothetical protein  37.25 
 
 		 69 aa  42.7  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2621  hypothetical protein  39.22 
 
 		 72 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120603  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>