29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_9224 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_9224  hypothetical protein  100 
 
 		 61 aa  121  3e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3470  hypothetical protein  83.61 
 
 		 61 aa  103  8e-22  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.599905  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4546  hypothetical protein  72.13 
 
 		 61 aa  92.8  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2785  hypothetical protein  66.1 
 
 		 61 aa  77  0.00000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.778108  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1816  hypothetical protein  62.71 
 
 		 78 aa  69.3  0.00000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.707667  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2252  hypothetical protein  54.24 
 
 		 69 aa  63.9  0.0000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2014  hypothetical protein  57.63 
 
 		 82 aa  62.4  0.000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16270  hypothetical protein  52.54 
 
 		 92 aa  59.3  0.00000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.020473  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1475  hypothetical protein  55.17 
 
 		 67 aa  58.2  0.00000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.707242  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21020  hypothetical protein  52.54 
 
 		 66 aa  57.4  0.00000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.606527 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2652  hypothetical protein  62.79 
 
 		 67 aa  57  0.00000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441179  normal  0.0488909 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2164  hypothetical protein  52.54 
 
 		 77 aa  56.2  0.0000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0247439  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2621  hypothetical protein  47.46 
 
 		 72 aa  56.2  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120603  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1907  hypothetical protein  47.46 
 
 		 77 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000016688 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2654  hypothetical protein  49.02 
 
 		 80 aa  52  0.000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00923338  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4901  hypothetical protein  61.54 
 
 		 67 aa  51.2  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342241  normal  0.0633468 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11780  hypothetical protein  44.83 
 
 		 79 aa  48.1  0.00004  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.166169  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2436  hypothetical protein  50.98 
 
 		 93 aa  48.1  0.00004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3527  hypothetical protein  49.02 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2315  hypothetical protein  46.15 
 
 		 75 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.626905  hitchhiker  0.00521659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2656  hypothetical protein  50 
 
 		 72 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20050  hypothetical protein  43.14 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408374  hitchhiker  0.00194499 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_13860  hypothetical protein  45.61 
 
 		 82 aa  44.7  0.0004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.000410267  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2131  hypothetical protein  52.38 
 
 		 84 aa  43.9  0.0008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.232195  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2771  hypothetical protein  47.06 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00046183  hitchhiker  0.000158734 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2161  hypothetical protein  44.9 
 
 		 75 aa  41.2  0.005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3223  hypothetical protein  43.14 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.245573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3173  hypothetical protein  43.14 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3161  hypothetical protein  43.14 
 
 		 83 aa  40.4  0.009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.738065  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>