23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2652 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2652  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  134  4e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441179  normal  0.0488909 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4901  hypothetical protein  84.13 
 
 		 67 aa  78.2  0.00000000000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342241  normal  0.0633468 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3470  hypothetical protein  67.31 
 
 		 61 aa  70.5  0.000000000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.599905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2785  hypothetical protein  63.46 
 
 		 61 aa  65.9  0.0000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.778108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3527  hypothetical protein  55.93 
 
 		 76 aa  63.9  0.0000000006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9224  hypothetical protein  61.54 
 
 		 61 aa  63.2  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4546  hypothetical protein  61.54 
 
 		 61 aa  63.5  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2771  hypothetical protein  50 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00046183  hitchhiker  0.000158734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2654  hypothetical protein  51.72 
 
 		 80 aa  61.6  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00923338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20050  hypothetical protein  43.75 
 
 		 75 aa  60.5  0.000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408374  hitchhiker  0.00194499 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2315  hypothetical protein  49.18 
 
 		 75 aa  56.2  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.626905  hitchhiker  0.00521659 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2161  hypothetical protein  52 
 
 		 75 aa  53.1  0.000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2436  hypothetical protein  54.17 
 
 		 93 aa  52  0.000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2621  hypothetical protein  43.4 
 
 		 72 aa  50.8  0.000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120603  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3161  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.738065  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3173  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3223  hypothetical protein  50 
 
 		 83 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.245573  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2014  hypothetical protein  49.06 
 
 		 82 aa  49.3  0.00002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1816  hypothetical protein  49.02 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.707667  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2656  hypothetical protein  46.94 
 
 		 72 aa  48.5  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2252  hypothetical protein  45.1 
 
 		 69 aa  44.3  0.0005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21020  hypothetical protein  42.59 
 
 		 66 aa  42.7  0.001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.606527 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3040  hypothetical protein  48.39 
 
 		 79 aa  41.6  0.004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.754474 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>