22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3223 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3161  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.738065  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3223  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.245573  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3173  hypothetical protein  100 
 
 
83 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3486  hypothetical protein  73.81 
 
 
88 aa  102  1e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0203743  normal  0.534669 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3040  hypothetical protein  76.32 
 
 
79 aa  100  9e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.754474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2436  hypothetical protein  49.33 
 
 
93 aa  77.4  0.00000000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3527  hypothetical protein  54.55 
 
 
76 aa  73.6  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2315  hypothetical protein  46.67 
 
 
75 aa  71.2  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.626905  hitchhiker  0.00521659 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2656  hypothetical protein  56.67 
 
 
72 aa  69.3  0.00000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2654  hypothetical protein  39.47 
 
 
80 aa  67  0.00000000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00923338  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2131  hypothetical protein  61.7 
 
 
84 aa  67.4  0.00000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.232195  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2161  hypothetical protein  48.39 
 
 
75 aa  67  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20050  hypothetical protein  45.61 
 
 
75 aa  66.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408374  hitchhiker  0.00194499 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2771  hypothetical protein  47.46 
 
 
103 aa  59.7  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00046183  hitchhiker  0.000158734 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2785  hypothetical protein  50 
 
 
61 aa  52  0.000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.778108  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4546  hypothetical protein  49.02 
 
 
61 aa  50.1  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3470  hypothetical protein  49.02 
 
 
61 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.599905  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2014  hypothetical protein  47.06 
 
 
82 aa  44.3  0.0006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2252  hypothetical protein  44.83 
 
 
69 aa  43.9  0.0008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2621  hypothetical protein  45.1 
 
 
72 aa  42.7  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120603  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11780  hypothetical protein  39.34 
 
 
79 aa  40.8  0.007  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.166169  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9224  hypothetical protein  43.14 
 
 
61 aa  40.4  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>