27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Franean1_4901 on replicon NC_009921
Organism: Frankia sp. EAN1pec



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009921  Franean1_4901  hypothetical protein  100 
 
 		 67 aa  133  7.000000000000001e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342241  normal  0.0633468 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2652  hypothetical protein  80.6 
 
 		 67 aa  78.2  0.00000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441179  normal  0.0488909 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20050  hypothetical protein  45.59 
 
 		 75 aa  67  0.00000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408374  hitchhiker  0.00194499 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3470  hypothetical protein  60.78 
 
 		 61 aa  62.8  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.599905  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2785  hypothetical protein  60.78 
 
 		 61 aa  61.2  0.000000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.778108  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3527  hypothetical protein  44.44 
 
 		 76 aa  60.5  0.000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2771  hypothetical protein  48.39 
 
 		 103 aa  60.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00046183  hitchhiker  0.000158734 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2654  hypothetical protein  50 
 
 		 80 aa  60.1  0.00000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00923338  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2315  hypothetical protein  50.85 
 
 		 75 aa  57.8  0.00000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.626905  hitchhiker  0.00521659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9224  hypothetical protein  56.86 
 
 		 61 aa  57  0.00000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4546  hypothetical protein  52.94 
 
 		 61 aa  56.6  0.0000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2161  hypothetical protein  54.17 
 
 		 75 aa  54.7  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2436  hypothetical protein  50 
 
 		 93 aa  54.7  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2656  hypothetical protein  51.02 
 
 		 72 aa  50.4  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3161  hypothetical protein  47.27 
 
 		 83 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.738065  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2621  hypothetical protein  47.06 
 
 		 72 aa  48.9  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120603  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3173  hypothetical protein  47.27 
 
 		 83 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3223  hypothetical protein  47.27 
 
 		 83 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.245573  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2252  hypothetical protein  45.1 
 
 		 69 aa  45.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.318577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1907  hypothetical protein  48.08 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000016688 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1816  hypothetical protein  45.1 
 
 		 78 aa  44.7  0.0005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.707667  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2164  hypothetical protein  48.08 
 
 		 77 aa  43.9  0.0007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0247439  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2014  hypothetical protein  47.06 
 
 		 82 aa  43.9  0.0007  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16270  hypothetical protein  45.1 
 
 		 92 aa  42.7  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.020473  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11780  hypothetical protein  44.23 
 
 		 79 aa  42  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.166169  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21020  hypothetical protein  43.14 
 
 		 66 aa  41.2  0.005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.606527 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1475  hypothetical protein  46.94 
 
 		 67 aa  40.4  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.707242  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>