25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2161 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_2161  hypothetical protein  100 
 
 
75 aa  152  2e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2315  hypothetical protein  89.33 
 
 
75 aa  136  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.626905  hitchhiker  0.00521659 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3527  hypothetical protein  65.57 
 
 
76 aa  81.3  0.000000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2656  hypothetical protein  59.68 
 
 
72 aa  75.9  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20050  hypothetical protein  62.96 
 
 
75 aa  74.3  0.0000000000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408374  hitchhiker  0.00194499 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2436  hypothetical protein  63.46 
 
 
93 aa  73.6  0.000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3161  hypothetical protein  48.53 
 
 
83 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.738065  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3223  hypothetical protein  48.53 
 
 
83 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.245573  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3173  hypothetical protein  48.53 
 
 
83 aa  72  0.000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2654  hypothetical protein  54.84 
 
 
80 aa  69.3  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00923338  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2771  hypothetical protein  67.31 
 
 
103 aa  68.9  0.00000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00046183  hitchhiker  0.000158734 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3040  hypothetical protein  52.05 
 
 
79 aa  67.4  0.00000000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.754474 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2131  hypothetical protein  55.36 
 
 
84 aa  65.9  0.0000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.232195  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3486  hypothetical protein  58.14 
 
 
88 aa  60.5  0.000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0203743  normal  0.534669 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2785  hypothetical protein  49.12 
 
 
61 aa  56.2  0.0000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.778108  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4546  hypothetical protein  45.45 
 
 
61 aa  50.8  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1816  hypothetical protein  44.44 
 
 
78 aa  47.4  0.00007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.707667  normal  0.210746 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4901  hypothetical protein  52.17 
 
 
67 aa  46.6  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.342241  normal  0.0633468 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16270  hypothetical protein  46.43 
 
 
92 aa  46.2  0.0002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.020473  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2621  hypothetical protein  41.07 
 
 
72 aa  45.4  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120603  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9224  hypothetical protein  46.3 
 
 
61 aa  45.4  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2652  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.441179  normal  0.0488909 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3470  hypothetical protein  44.44 
 
 
61 aa  44.7  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.599905  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2252  hypothetical protein  40.35 
 
 
69 aa  44.3  0.0006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2014  hypothetical protein  44.23 
 
 
82 aa  42.7  0.002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>