23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3486 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3486  hypothetical protein  100 
 
 
88 aa  173  8e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0203743  normal  0.534669 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3161  hypothetical protein  73.81 
 
 
83 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.738065  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3223  hypothetical protein  73.81 
 
 
83 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.245573  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3173  hypothetical protein  73.81 
 
 
83 aa  120  6e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3040  hypothetical protein  82.5 
 
 
79 aa  106  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.754474 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2436  hypothetical protein  62.69 
 
 
93 aa  83.2  0.000000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2656  hypothetical protein  59.02 
 
 
72 aa  75.1  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3527  hypothetical protein  51.39 
 
 
76 aa  73.2  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.328618  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2315  hypothetical protein  52.54 
 
 
75 aa  72  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.626905  hitchhiker  0.00521659 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2131  hypothetical protein  66.13 
 
 
84 aa  71.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.232195  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2654  hypothetical protein  43.42 
 
 
80 aa  68.9  0.00000000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  decreased coverage  0.00923338  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20050  hypothetical protein  46.38 
 
 
75 aa  68.2  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.408374  hitchhiker  0.00194499 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2161  hypothetical protein  58.33 
 
 
75 aa  66.6  0.00000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2771  hypothetical protein  53.85 
 
 
103 aa  57.4  0.00000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00046183  hitchhiker  0.000158734 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4546  hypothetical protein  53.85 
 
 
61 aa  54.3  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2785  hypothetical protein  54.9 
 
 
61 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.778108  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2252  hypothetical protein  46.15 
 
 
69 aa  49.3  0.00002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.318577  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3470  hypothetical protein  54.9 
 
 
61 aa  48.9  0.00002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.599905  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2014  hypothetical protein  50 
 
 
82 aa  47  0.00009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21020  hypothetical protein  46.43 
 
 
66 aa  45.8  0.0002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.606527 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9224  hypothetical protein  49.02 
 
 
61 aa  44.3  0.0006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2621  hypothetical protein  45.1 
 
 
72 aa  42  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.120603  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1816  hypothetical protein  42.86 
 
 
78 aa  41.6  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.707667  normal  0.210746 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>