23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10370 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10370  hypothetical protein  100 
 
 		 198 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.0477312 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5367  hypothetical protein  48.12 
 
 		 245 aa  136  2e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.66384  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4976  hypothetical protein  40 
 
 		 149 aa  89.7  2e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0264  hypothetical protein  33.95 
 
 		 151 aa  64.7  0.0000000008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0097304 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4611  hypothetical protein  33.33 
 
 		 155 aa  61.2  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3158  hypothetical protein  34.07 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.441346  normal  0.128746 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26950  hypothetical protein  32.89 
 
 		 146 aa  60.1  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.521491 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3201  TonB-dependent siderophore receptor  35.9 
 
 		 154 aa  59.7  0.00000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0018  hypothetical protein  30.06 
 
 		 154 aa  58.5  0.00000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.073106 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4233  hypothetical protein  32.72 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.20393  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4318  hypothetical protein  32.72 
 
 		 155 aa  57.8  0.00000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.167531  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4139  hypothetical protein  30.88 
 
 		 169 aa  54.3  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.374111 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0752  hypothetical protein  31.33 
 
 		 154 aa  52.8  0.000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00734752 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1697  hypothetical protein  31.47 
 
 		 155 aa  52  0.000005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00655824 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1716  hypothetical protein  34.06 
 
 		 153 aa  48.9  0.00005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0951293  normal  0.16109 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1626  hypothetical protein  40.19 
 
 		 117 aa  48.9  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.34451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11350  hypothetical protein  30.23 
 
 		 122 aa  48.9  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.965322 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0625  hypothetical protein  33.11 
 
 		 156 aa  47.8  0.0001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1470  hypothetical protein  32.09 
 
 		 137 aa  47.4  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5079  hypothetical protein  30.19 
 
 		 154 aa  47.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.309387  normal  0.255994 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0734  hypothetical protein  30.6 
 
 		 167 aa  46.2  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116764  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1893  hypothetical protein  37.88 
 
 		 323 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0851  hypothetical protein  31.97 
 
 		 151 aa  41.6  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.398648  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>