87 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_1240 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007575  Suden_1240  putative radical-activating enzyme  100 
 
 		 193 aa  387  1e-107  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.375675  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0050  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  49.48 
 
 		 231 aa  183  1.0000000000000001e-45  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1126  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  45.36 
 
 		 225 aa  181  9.000000000000001e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0860  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  46.39 
 
 		 250 aa  177  5.999999999999999e-44  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0456  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  50.25 
 
 		 227 aa  177  8e-44  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.0020747  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0024  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  47.42 
 
 		 223 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.447607  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0427  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  44.33 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4060  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  43.08 
 
 		 195 aa  160  8.000000000000001e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1899  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  43.3 
 
 		 234 aa  158  4e-38  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000119044  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11040  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  33.68 
 
 		 231 aa  112  3e-24  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.219865  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1188  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  35.71 
 
 		 205 aa  111  7.000000000000001e-24  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.324366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2170  putative pyruvate radical-activating enzyme  36.75 
 
 		 229 aa  109  2.0000000000000002e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.120607  hitchhiker  0.00900757 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1145  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  35.71 
 
 		 228 aa  106  2e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.17989  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0647  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  33.16 
 
 		 229 aa  99  3e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2640  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  32.53 
 
 		 233 aa  98.6  5e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0085  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.83 
 
 		 228 aa  97.8  9e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2206  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  35.09 
 
 		 232 aa  96.7  2e-19  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.915937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0104  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.84 
 
 		 256 aa  95.5  5e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2732  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.19 
 
 		 240 aa  95.1  6e-19  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0965  putative ribonucleotide reductase activating transmembrane protein  34.44 
 
 		 246 aa  95.1  6e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.425469 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2732  pyruvate-formate lyase-activating enzyme  33.14 
 
 		 231 aa  94.4  9e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.107407  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3515  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  30 
 
 		 219 aa  94  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.215518 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1808  radical SAM domain-containing protein  31.84 
 
 		 239 aa  93.6  2e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1274  radical SAM family protein  29.74 
 
 		 232 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0341  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  33.87 
 
 		 231 aa  92.8  3e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4659  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.58 
 
 		 237 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1699  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  34.32 
 
 		 228 aa  91.7  6e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5137  ribonucleoside triphosphate reductase-activating protein (NrdG-D activase)  30.52 
 
 		 223 aa  91.7  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.280375 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3582  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.58 
 
 		 237 aa  91.7  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2744  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.84 
 
 		 239 aa  91.3  7e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.831593  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2342  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.49 
 
 		 240 aa  90.9  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00360536 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1448  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  32.12 
 
 		 234 aa  91.3  9e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.236799 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2720  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase, beta subunit  28.49 
 
 		 233 aa  90.9  9e-18  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2687  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.28 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1700  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.28 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77607  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0627  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.241542  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2385  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.28 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2810  radical SAM domain-containing protein  31.28 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2902  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.28 
 
 		 239 aa  90.9  1e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.568688  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1784  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.71 
 
 		 237 aa  89.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0286287  normal  0.825212 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2108  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.71 
 
 		 237 aa  88.6  6e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1192  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  37.01 
 
 		 255 aa  88.6  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0898725 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3894  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  32.18 
 
 		 232 aa  87.8  8e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1692  putative ribonucleotide reductase activating transmembrane protein  29.76 
 
 		 223 aa  87  1e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.016777  normal  0.651661 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2569  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  33.33 
 
 		 229 aa  87  2e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000247399  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3481  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.76 
 
 		 235 aa  86.3  3e-16  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.326751  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0634  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  35.1 
 
 		 227 aa  85.9  3e-16  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000476119  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39710  putative radical-activating enzyme  27.51 
 
 		 232 aa  85.1  6e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1402  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  37.86 
 
 		 234 aa  82.8  0.000000000000003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.012996  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3367  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase-activating protein  26.56 
 
 		 232 aa  82.8  0.000000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.179526  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0979  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  33.1 
 
 		 213 aa  81.6  0.000000000000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2272  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like protein  32.98 
 
 		 254 aa  81.6  0.000000000000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.487332  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0370  ribonucleoside-triphosphate reductase, anaerobic-like  30.68 
 
 		 238 aa  80.9  0.00000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2987  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.1 
 
 		 208 aa  79.7  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.39802 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1601  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  32.45 
 
 		 236 aa  79.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18280  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30.3 
 
 		 231 aa  77.8  0.00000000000008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.726853  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1781  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.97 
 
 		 193 aa  77.8  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.277436  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0151  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.22 
 
 		 232 aa  77.4  0.0000000000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1600  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.66 
 
 		 228 aa  77.4  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0907  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  30.77 
 
 		 251 aa  77.4  0.0000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1027  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.93 
 
 		 242 aa  77  0.0000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.290473  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1994  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.66 
 
 		 263 aa  76.6  0.0000000000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.925403  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0278  radical SAM domain-containing protein  36.67 
 
 		 238 aa  76.3  0.0000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0306  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.27 
 
 		 239 aa  75.5  0.0000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0353872 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0893  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.32 
 
 		 208 aa  73.2  0.000000000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0237925  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1453  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  35.95 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0238832  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0313  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  31.76 
 
 		 242 aa  72.4  0.000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.331207  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2767  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.76 
 
 		 250 aa  72.4  0.000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000561668 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1058  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  24.29 
 
 		 244 aa  71.2  0.000000000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.448399  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0516  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  32.45 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0252566  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2621  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  24.74 
 
 		 245 aa  70.1  0.00000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1856  radical SAM domain-containing protein  29.41 
 
 		 247 aa  68.9  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.0000000120837  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0069  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  32.11 
 
 		 208 aa  63.2  0.000000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0514  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  29.88 
 
 		 227 aa  62.4  0.000000004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1818  Radical SAM domain protein  27.35 
 
 		 238 aa  57  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1036  radical activating enzyme  27.57 
 
 		 260 aa  55.1  0.0000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1713  radical SAM family protein  29.41 
 
 		 222 aa  54.3  0.000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2680  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  27.35 
 
 		 245 aa  52  0.000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.549687  normal  0.538488 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1314  Radical SAM domain protein  27.33 
 
 		 208 aa  52  0.000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0737076  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3396  Radical SAM domain protein  26.55 
 
 		 212 aa  50.1  0.00002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1594  radical SAM domain-containing protein  30.39 
 
 		 270 aa  50.4  0.00002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.102541 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1777  (Formate-C-acetyltransferase)-activating enzyme  27.64 
 
 		 279 aa  45.4  0.0005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000493175  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1557  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  26.45 
 
 		 232 aa  45.1  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0341797  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2883  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 222 aa  43.1  0.003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.470396  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3374  hypothetical protein  30.36 
 
 		 223 aa  41.6  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1976  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  25.83 
 
 		 245 aa  41.6  0.007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.505832 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3531  hypothetical protein  30.36 
 
 		 223 aa  41.2  0.01  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.786232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>