13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Suden_0950 on replicon NC_007575
Organism: Sulfurimonas denitrificans DSM 1251



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007575  Suden_0950  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  647    Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.785839  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0964  hypothetical protein  35.82 
 
 
343 aa  189  4e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1015  hypothetical protein  35.02 
 
 
322 aa  159  5e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0906431  n/a   
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3695  hypothetical protein  32.08 
 
 
311 aa  146  5e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.483298  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2116  hypothetical protein  30.98 
 
 
322 aa  142  5e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1424  hypothetical protein  30.31 
 
 
321 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.82629  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0856  hypothetical protein  33.33 
 
 
321 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0941  hypothetical protein  38.95 
 
 
192 aa  115  1.0000000000000001e-24  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.421958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  22.73 
 
 
318 aa  59.7  0.00000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1431  phage integrase family protein  26.58 
 
 
296 aa  56.2  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010715  Nther_2945  phage integrase  19.4 
 
 
316 aa  48.5  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.79215e-44  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0686  phage integrase family protein  54.35 
 
 
295 aa  47.4  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1415  integrase family protein  22.77 
 
 
316 aa  44.3  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>