12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0686 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0686  phage integrase family protein  100 
 
 
295 aa  597  1e-170  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1431  phage integrase family protein  48.43 
 
 
296 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4432  phage integrase family protein  40.15 
 
 
313 aa  152  7e-36  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.62403  normal  0.417211 
 
 
-
 
NC_010815  Glov_3695  hypothetical protein  36.52 
 
 
311 aa  61.2  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.483298  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2116  hypothetical protein  31.38 
 
 
322 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0361  Phage integrase  31.22 
 
 
318 aa  53.9  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000000010858  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1015  hypothetical protein  33.68 
 
 
322 aa  53.1  0.000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0906431  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1210  phage integrase family protein  28.42 
 
 
379 aa  52.4  0.000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0590479  n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1356  hypothetical protein  50.98 
 
 
76 aa  49.7  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.527083  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0950  hypothetical protein  54.35 
 
 
313 aa  47.4  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.785839  n/a   
 
 
-
 
NC_011730  PCC7424_5548  integrase family protein  29.28 
 
 
289 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0964  hypothetical protein  42.42 
 
 
343 aa  45.4  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>