More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4416 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013161  Cyan8802_1861  amino acid adenylation domain protein  36.55 
 
 
2571 aa  655    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3094  amino acid adenylation domain protein  33.83 
 
 
3086 aa  670    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.54199 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3683  amino acid adenylation domain protein  35.28 
 
 
2664 aa  642    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3686  amino acid adenylation domain protein  35.28 
 
 
2395 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05860  peptide synthetase protein  38.67 
 
 
6889 aa  639    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3026  amino acid adenylation domain protein  34.1 
 
 
1556 aa  670    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6812  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  39.37 
 
 
2370 aa  652    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7306  peptide synthetase  36.07 
 
 
1506 aa  740    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.370247  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4376  linear gramicidin synthetase subunit D  28.64 
 
 
2054 aa  649    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.459682  hitchhiker  5.79111e-19 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1835  amino acid adenylation domain protein  36.55 
 
 
2571 aa  654    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3740  amino acid adenylation domain protein  35.28 
 
 
2395 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.209532 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6814  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase module  39.8 
 
 
8646 aa  637    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1610  amino acid adenylation  36.14 
 
 
1142 aa  645    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0752074 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1611  amino acid adenylation  37.78 
 
 
3308 aa  677    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0144172 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1613  non-ribosomal peptide synthase  37.36 
 
 
3498 aa  696    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0181375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4099  non-ribosomal peptide synthase  35.88 
 
 
2033 aa  654    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.908444 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4109  amino acid adenylation  34.41 
 
 
1786 aa  638    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.208816  normal  0.227369 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3095  amino acid adenylation domain protein  34.01 
 
 
1556 aa  672    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1935  amino acid adenylation domain-containing protein  34.22 
 
 
3291 aa  671    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5750  amino acid adenylation domain protein  33.04 
 
 
1454 aa  755    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4110  putative non-ribosomal peptide synthase  33.72 
 
 
1498 aa  639    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.734915  normal  0.2622 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4416  amino acid adenylation domain-containing protein  100 
 
 
1485 aa  2899    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5870  amino acid adenylation domain protein  33.55 
 
 
2164 aa  643    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2186  non-ribosomal peptide synthase MxaA  47.3 
 
 
1436 aa  1065    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026407  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3737  amino acid adenylation domain protein  35.28 
 
 
3824 aa  644    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0118377 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4890  amino acid adenylation domain-containing protein  89.7 
 
 
1500 aa  2514    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.365672 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3027  amino acid adenylation domain protein  33.83 
 
 
3086 aa  671    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05859  peptide synthetase protein  38.79 
 
 
5953 aa  634  1e-180  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5872  amino acid adenylation domain protein  34.58 
 
 
1550 aa  632  1e-179  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00539466 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3722  amino acid adenylation  37.57 
 
 
6676 aa  632  1e-179  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1830  amino acid adenylation  36.9 
 
 
1138 aa  632  1e-179  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5618  amino acid adenylation domain-containing protein  33.1 
 
 
2156 aa  632  1e-179  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33650  pyoverdine synthetase D  37.88 
 
 
2448 aa  633  1e-179  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.769726  normal  0.0679691 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1367  amino acid adenylation domain protein  38.67 
 
 
6403 aa  627  1e-178  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6813  arthrofactin synthetase/syringopeptin synthetase C-related non-ribosomal peptide synthetase  40.19 
 
 
4383 aa  626  1e-178  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2462  linear gramicidin synthetase subunit D  33.04 
 
 
2156 aa  628  1e-178  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25580  peptide synthase  37.8 
 
 
4747 aa  627  1e-178  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0980  amino acid adenylation domain protein  32.96 
 
 
2193 aa  625  1e-177  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2874  non-ribosomal peptide synthase  33.04 
 
 
2156 aa  622  1e-176  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25570  peptide synthase  38.55 
 
 
5213 aa  619  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4699  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  36.25 
 
 
4531 aa  612  1e-173  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6472  amino acid adenylation domain-containing protein  38.65 
 
 
8914 aa  612  1e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6842  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.63 
 
 
1876 aa  610  1e-173  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.731708  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0695  non-ribosomal peptide synthetase  38.11 
 
 
3291 aa  607  9.999999999999999e-173  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.622014  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6473  amino acid adenylation domain-containing protein  38.68 
 
 
8915 aa  607  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.47545 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2859  peptide synthase  37.33 
 
 
4991 aa  608  9.999999999999999e-173  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5617  amino acid adenylation domain-containing protein  33.97 
 
 
4968 aa  609  9.999999999999999e-173  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2608  amino acid adenylation  38.53 
 
 
9498 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2616  amino acid adenylation  36.26 
 
 
13537 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0002  amino acid adenylation  33.55 
 
 
2867 aa  605  1.0000000000000001e-171  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0171576 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4084  amino acid adenylation domain-containing protein  37.02 
 
 
1114 aa  606  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.85613  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10102  peptide synthetase nrp  34.87 
 
 
2512 aa  606  1.0000000000000001e-171  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1675  amino acid adenylation domain-containing protein  35.96 
 
 
1129 aa  604  1.0000000000000001e-171  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4519  non-ribosomal peptide synthetase, terminal component  36.01 
 
 
3432 aa  601  1e-170  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5756  amino acid adenylation domain protein  33.39 
 
 
2581 aa  603  1e-170  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.314171 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1945  peptide synthase  36.6 
 
 
4336 aa  600  1e-170  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1846  peptide synthase  35.73 
 
 
4502 aa  602  1e-170  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2873  bacitracin synthetase 1  33.79 
 
 
4960 aa  601  1e-170  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2463  bacitracin synthetase 1  33.24 
 
 
4960 aa  600  1e-170  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33630  PvdJ  37.34 
 
 
2189 aa  602  1e-170  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.795242  normal  0.135203 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2331  amino acid adenylation domain protein  32.19 
 
 
3235 aa  601  1e-170  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2208  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.38 
 
 
1829 aa  603  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.190766  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2213  non-ribosomal peptide synthase  37.63 
 
 
4468 aa  600  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2214  syringomycin synthetase  38.02 
 
 
3348 aa  602  1e-170  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2135  pyoverdine chromophore precursor synthetase  36.27 
 
 
4336 aa  599  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2149  pyoverdine sidechain peptide synthetase III, L-Thr-L-Ser component  35.01 
 
 
2151 aa  598  1e-169  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0982  amino acid adenylation domain protein  32.51 
 
 
2006 aa  598  1e-169  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2213  amino acid adenylation  38.41 
 
 
4882 aa  596  1e-169  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0363  amino acid adenylation domain-containing protein  39.24 
 
 
2125 aa  599  1e-169  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.831612 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  26.31 
 
 
2439 aa  596  1e-169  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2212  non-ribosomal peptide synthase  36.77 
 
 
6081 aa  597  1e-169  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3746  amino acid adenylation domain protein  36.67 
 
 
1776 aa  594  1e-168  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0694  hypothetical protein  37.33 
 
 
4572 aa  595  1e-168  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5583  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  40.15 
 
 
1806 aa  595  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.786514 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4658  amino acid adenylation domain-containing protein  33.6 
 
 
1449 aa  593  1e-168  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.702591  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2420  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  38.23 
 
 
1839 aa  590  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.452144  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  37.02 
 
 
2154 aa  591  1e-167  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0693  hypothetical protein  36.02 
 
 
6072 aa  592  1e-167  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1904  amino acid adenylation domain-containing protein  31.63 
 
 
1833 aa  593  1e-167  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.844763  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2415  amino acid adenylation domain-containing protein  33.98 
 
 
1127 aa  588  1e-166  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3743  amino acid adenylation domain protein  37.27 
 
 
2626 aa  588  1e-166  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4083  amino acid adenylation domain-containing protein  35.64 
 
 
3942 aa  587  1e-166  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.223479 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2869  amino acid adenylation domain-containing protein  37 
 
 
5328 aa  587  1e-166  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.127211 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1748  amino acid adenylation domain protein  38.06 
 
 
7712 aa  585  1.0000000000000001e-165  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.970061 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2830  non-ribosomal peptide synthetase SyfB  37.24 
 
 
5929 aa  583  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0845  amino acid adenylation domain-containing protein  34.54 
 
 
1119 aa  584  1.0000000000000001e-165  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0731661  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2381  amino acid adenylation domain protein  31.18 
 
 
4196 aa  583  1.0000000000000001e-165  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3972  amino acid adenylation domain-containing protein  37.41 
 
 
1126 aa  585  1.0000000000000001e-165  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.47287  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2858  peptide synthase  36.73 
 
 
4136 aa  584  1.0000000000000001e-165  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1882  amino acid adenylation domain-containing protein  38.52 
 
 
5596 aa  582  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4086  amino acid adenylation domain-containing protein  36.04 
 
 
2155 aa  581  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1829  amino acid adenylation  35.1 
 
 
4037 aa  582  1e-164  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_33610  peptide synthase  36.43 
 
 
5149 aa  582  1e-164  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.844682 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3546  amino acid adenylation domain-containing protein  38.22 
 
 
3404 aa  583  1e-164  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3973  amino acid adenylation domain-containing protein  37.75 
 
 
6661 aa  582  1e-164  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1792  amino acid adenylation  36.75 
 
 
3021 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.277992 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  39.03 
 
 
3639 aa  578  1.0000000000000001e-163  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5075  amino acid adenylation domain protein  37.43 
 
 
1769 aa  578  1.0000000000000001e-163  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944137  normal  0.714561 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2265  amino acid adenylation  36.06 
 
 
3002 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.580207  normal 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9643  peptide synthetase  35.5 
 
 
2561 aa  576  1.0000000000000001e-163  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>