62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_4157 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_4157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  100 
 
 
295 aa  589  1e-167  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3327  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  59.93 
 
 
299 aa  370  1e-101  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.846419  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2748  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.14 
 
 
297 aa  361  8e-99  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.87162 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2704  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.14 
 
 
297 aa  361  8e-99  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.489417  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2734  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.14 
 
 
297 aa  361  8e-99  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.588221  normal  0.12423 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.62 
 
 
306 aa  360  2e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0568935  normal  0.982462 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3550  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  59.73 
 
 
300 aa  358  5e-98  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.180027 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03157  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  59.04 
 
 
299 aa  347  1e-94  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2156  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  60.07 
 
 
294 aa  346  3e-94  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0953  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57.14 
 
 
298 aa  342  5.999999999999999e-93  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1087  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.97 
 
 
296 aa  341  9e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00966018  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1976  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  58.56 
 
 
300 aa  337  1.9999999999999998e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.162018 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0085  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  54.42 
 
 
296 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.249059  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2273  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  56.12 
 
 
296 aa  335  7e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1693  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.59 
 
 
296 aa  334  1e-90  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.795588 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2628  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  56.66 
 
 
296 aa  332  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  56.66 
 
 
296 aa  332  3e-90  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1755  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.14 
 
 
293 aa  331  9e-90  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0092  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  53.06 
 
 
296 aa  330  2e-89  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2166  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  57 
 
 
296 aa  330  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0340  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  53.4 
 
 
295 aa  320  1.9999999999999998e-86  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3208  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  54.11 
 
 
296 aa  319  3e-86  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2606  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  54.76 
 
 
298 aa  318  5e-86  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.056888  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42447  cytosolic aldolase  55.12 
 
 
299 aa  317  2e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.134793  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2128  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  53.58 
 
 
321 aa  315  4e-85  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1964  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  52.72 
 
 
301 aa  311  5.999999999999999e-84  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0905905  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18420  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  53.08 
 
 
294 aa  311  1e-83  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.24843  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3578  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  53.06 
 
 
298 aa  311  1e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.674001 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1341  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  51.88 
 
 
296 aa  309  5e-83  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.352991 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1516  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  55.71 
 
 
298 aa  308  5e-83  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.821863  normal  0.336499 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2682  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  50.17 
 
 
299 aa  302  5.000000000000001e-81  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.815195  normal  0.10767 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1317  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  50.85 
 
 
296 aa  290  1e-77  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.274126 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08451  fructose-1,6-bisphosphate aldolase class I  26.54 
 
 
355 aa  57  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1149  Fructose-bisphosphate aldolase  28.73 
 
 
334 aa  54.3  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0710998  hitchhiker  0.00000000000576119 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08001  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  26.27 
 
 
355 aa  53.9  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3213  Fructose-bisphosphate aldolase  27.54 
 
 
334 aa  52.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0504236  normal  0.268274 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0188  fructose-bisphosphate aldolase  29.7 
 
 
355 aa  50.4  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.709503  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1951  fructose-bisphosphate aldolase  27.14 
 
 
359 aa  50.1  0.00004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.750609 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_13796  predicted protein  31.21 
 
 
336 aa  50.1  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.994398  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0519  fructose-bisphosphate aldolase  27.71 
 
 
335 aa  50.1  0.00005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.0019401  normal  0.235286 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08201  fructose-1,6-bisphosphate aldolase  29.7 
 
 
355 aa  49.7  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3652  fructose bisphosphate aldolase  29.84 
 
 
341 aa  48.5  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0796  fructose-bisphosphate aldolase  30.73 
 
 
355 aa  47.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.776973  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3534  fructose-bisphosphate aldolase  30 
 
 
343 aa  47.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3478  Fructose-bisphosphate aldolase  26.77 
 
 
348 aa  48.1  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3539  Fructose-bisphosphate aldolase  29.21 
 
 
341 aa  47  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4512  fructose-bisphosphate aldolase  28.41 
 
 
343 aa  47  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.232594  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2541  fructose-bisphosphate aldolase  28.41 
 
 
341 aa  46.6  0.0005  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.242648  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3242  Fructose-bisphosphate aldolase  31.33 
 
 
341 aa  46.6  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.453092 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1946  fructose-bisphosphate aldolase  28.17 
 
 
334 aa  46.6  0.0005  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2023  fructose-bisphosphate aldolase  28.17 
 
 
334 aa  46.6  0.0005  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1927  Fructose-bisphosphate aldolase  30 
 
 
338 aa  46.2  0.0006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02119  fructose-bisphosphate aldolase class-I  28.31 
 
 
334 aa  46.2  0.0007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1058  fructose-bisphosphate aldolase  27.91 
 
 
339 aa  45.4  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1513  fructose-bisphosphate aldolase  27.9 
 
 
340 aa  45.4  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.205372 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4317  fructose-bisphosphate aldolase  28.87 
 
 
342 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.280107  normal  0.443925 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1010  Fructose-bisphosphate aldolase  27.21 
 
 
344 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1687  fructose-bisphosphate aldolase  28.33 
 
 
346 aa  43.9  0.003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.275968  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2105  fructose-bisphosphate aldolase  25.18 
 
 
339 aa  43.5  0.004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.267884  normal  0.0305048 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0511  hypothetical protein  31.4 
 
 
336 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0535  hypothetical protein  31.4 
 
 
336 aa  43.1  0.005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_51289  fructose-bisphosphate aldolase  26.96 
 
 
401 aa  43.1  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.341823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>