14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2843 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2843  hypothetical protein  100 
 
 		 110 aa  223  6e-58  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0726  hypothetical protein  44.78 
 
 		 167 aa  56.2  0.0000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  37.04 
 
 		 181 aa  52.8  0.000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  38.1 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  44.93 
 
 		 1093 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2282  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  46.3 
 
 		 320 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  44.93 
 
 		 1093 aa  49.7  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  46.3 
 
 		 320 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0783564  normal  0.0873524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  48.21 
 
 		 1089 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2321  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  46.3 
 
 		 320 aa  48.9  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0672  hypothetical protein  39.74 
 
 		 85 aa  47.4  0.00008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.368804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  42 
 
 		 1110 aa  44.3  0.0006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  37.5 
 
 		 184 aa  43.5  0.0009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  31.96 
 
 		 228 aa  42.7  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>