43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2056 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2056  hypothetical protein  100 
 
 		 257 aa  517  1e-146  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2046  hypothetical protein  82.42 
 
 		 257 aa  441  1e-123  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.15378  hitchhiker  0.00220889 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0742  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  43.97 
 
 		 251 aa  193  3e-48  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4841  hypothetical protein  40.81 
 
 		 268 aa  171  1e-41  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.781008  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4223  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  40.62 
 
 		 273 aa  167  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3751  hypothetical protein  38.68 
 
 		 259 aa  163  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.186525 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4404  hypothetical protein  32.16 
 
 		 273 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0160  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.899494  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0147  hypothetical protein  33.33 
 
 		 261 aa  123  4e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3746  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  33.49 
 
 		 240 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.521801 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3337  hypothetical protein  34.02 
 
 		 260 aa  116  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.370966 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2763  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  32.87 
 
 		 222 aa  115  5e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.076486  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27720  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  44.35 
 
 		 143 aa  102  8e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.26265  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0248  dTDP-6-deoxy-L-hexose 3-O-methyltransferase  27.73 
 
 		 276 aa  97.1  3e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.323725  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3108  hypothetical protein  28.44 
 
 		 252 aa  86.7  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2761  hypothetical protein  29.71 
 
 		 434 aa  75.5  0.0000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2907  hypothetical protein  29.14 
 
 		 434 aa  72  0.000000000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4288  hypothetical protein  34.42 
 
 		 282 aa  57.8  0.0000002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2516  methyltransferase  28.16 
 
 		 230 aa  57  0.0000003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.524649  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0597  hypothetical protein  29.34 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5642  hypothetical protein  27.47 
 
 		 316 aa  55.1  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1318  hypothetical protein  27.49 
 
 		 227 aa  54.7  0.000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.575066  hitchhiker  0.000000517485 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1603  methyltransferase  26.14 
 
 		 250 aa  54.7  0.000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0961948  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4202  hypothetical protein  27.84 
 
 		 250 aa  54.3  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.994524 
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_36844  predicted protein  27.95 
 
 		 382 aa  52.8  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5644  hypothetical protein  26.56 
 
 		 324 aa  52  0.000009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2171  hypothetical protein  29.76 
 
 		 213 aa  52  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.3355  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2468  hypothetical protein  32.67 
 
 		 281 aa  52  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.789559  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2577  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  32.54 
 
 		 268 aa  52  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000150088  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1203  putative methyltransferase  33.33 
 
 		 266 aa  51.6  0.00001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.139767  normal  0.896147 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1480  hypothetical protein  28.57 
 
 		 232 aa  51.2  0.00002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.213383  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3219  hypothetical protein  28.05 
 
 		 322 aa  50.1  0.00004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0641  hypothetical protein  25.25 
 
 		 286 aa  48.5  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0804616  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2419  macrocin-O-methyltransferase  28.65 
 
 		 277 aa  48.1  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3930  asparagine synthase (glutamine-hydrolyzing)  26.7 
 
 		 236 aa  44.3  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.252364 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1531  hypothetical protein  28.26 
 
 		 265 aa  44.7  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.842491  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3453  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  24.89 
 
 		 485 aa  43.9  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2848  macrocin-O-methyltransferase domain-containing protein  28.47 
 
 		 261 aa  43.5  0.003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.360921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1291  macrocin-O-methyltransferase  28.49 
 
 		 291 aa  43.5  0.003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5468  hypothetical protein  25.64 
 
 		 252 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1835  putative methyltransferase  30.17 
 
 		 258 aa  43.5  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0428  glycosyltransferase-like protein  27.39 
 
 		 642 aa  43.1  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1366  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 402 aa  43.5  0.004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.104941  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>