16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1593 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1593  hypothetical protein  100 
 
 		 371 aa  733    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1553  hypothetical protein  86.26 
 
 		 357 aa  594  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0165231  hitchhiker  0.00912158 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4840  hypothetical protein  45.14 
 
 		 367 aa  295  6e-79  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3424  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  42.71 
 
 		 381 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.272957 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0385  hypothetical protein  38.25 
 
 		 384 aa  186  5e-46  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0752  hypothetical protein  32.98 
 
 		 400 aa  150  3e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.947479  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01680  hypothetical protein  33.25 
 
 		 396 aa  150  3e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.607562  normal  0.13403 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6299  hypothetical protein  30.49 
 
 		 324 aa  138  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1293  hypothetical protein  32.97 
 
 		 416 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.896512  hitchhiker  0.00148296 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0930  hypothetical protein  30.79 
 
 		 390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.87104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0857  hypothetical protein  27.18 
 
 		 395 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.583299  normal  0.0121379 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1207  hypothetical protein  27.48 
 
 		 392 aa  100  5e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.556738  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3302  putative sigma E regulatory protein, MucB/RseB  32.31 
 
 		 354 aa  94.7  2e-18  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.663366  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5741  hypothetical protein  26.19 
 
 		 403 aa  61.6  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3382  hypothetical protein  23.81 
 
 		 369 aa  50.1  0.00006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000236638  normal  0.0236952 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1750  Outer membrane lipoprotein-sorting protein-like protein  25.41 
 
 		 362 aa  43.9  0.004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>