32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_1483 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_1483  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  100 
 
 		 126 aa  252  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.311126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1448  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  96.83 
 
 		 126 aa  248  2e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.362896  hitchhiker  0.00185234 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1518  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  57.76 
 
 		 125 aa  133  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.859194  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1874  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  56.1 
 
 		 125 aa  130  3.9999999999999996e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.809864  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6762  hypothetical protein  51.26 
 
 		 130 aa  126  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0790875 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4530  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  56.76 
 
 		 127 aa  121  3e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.471284  normal  0.96843 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3759  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  52.14 
 
 		 122 aa  117  3.9999999999999996e-26  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000195946  normal  0.398005 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1708  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  53.33 
 
 		 140 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248195  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5194  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  48.36 
 
 		 133 aa  112  2.0000000000000002e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.9488  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2288  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  55.46 
 
 		 136 aa  110  8.000000000000001e-24  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.208905 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2022  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  48.65 
 
 		 781 aa  108  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.8083  normal  0.142802 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2254  hypothetical protein  47.83 
 
 		 124 aa  107  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0978223  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1559  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  47.32 
 
 		 133 aa  105  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.311363  normal  0.277265 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  45.16 
 
 		 138 aa  99.4  1e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1400  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  46.28 
 
 		 133 aa  99.4  1e-20  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2240  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  44.8 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0519267  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2183  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  44.8 
 
 		 123 aa  99.8  1e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28168  hitchhiker  0.00382981 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_16140  OB-fold nucleic acid binding protein  50.86 
 
 		 122 aa  97.4  5e-20  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.24417  normal  0.140824 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3930  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  44.35 
 
 		 136 aa  97.4  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0928391  normal  0.448603 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2470  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  44.35 
 
 		 131 aa  95.9  1e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.216244  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1320  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  44.17 
 
 		 128 aa  94.7  4e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.434998 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12709  hypothetical protein  44.92 
 
 		 122 aa  92  2e-18  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.11862  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1939  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  47.37 
 
 		 125 aa  91.3  4e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0266133 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1705  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  45.87 
 
 		 122 aa  90.1  1e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.041605  normal  0.0985281 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1920  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  44.54 
 
 		 122 aa  89  2e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.286394  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2906  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  43.33 
 
 		 120 aa  87  8e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1408  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  40.71 
 
 		 126 aa  85.9  2e-16  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.492299 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7673  nucleic acid binding OB-fold tRNA/helicase-type  47.3 
 
 		 815 aa  66.6  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.803412  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1194  nucleic acid binding, OB-fold, tRNA/helicase-type  38.67 
 
 		 774 aa  53.1  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.701127  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1638  hypothetical protein  38.64 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0363241  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13100  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  42  0.003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  hitchhiker  0.00241513  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1631  hypothetical protein  28.85 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000113921 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>