16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0726 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_0726  hypothetical protein  100 
 
 		 167 aa  327  5.0000000000000004e-89  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.290467 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0672  hypothetical protein  82.89 
 
 		 85 aa  123  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.368804  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0670  hypothetical protein  31.46 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2282  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  50.88 
 
 		 320 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.441037  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2329  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  50.88 
 
 		 320 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0783564  normal  0.0873524 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2321  peptidyl-prolyl cis-trans isomerase, cyclophilin type  50.88 
 
 		 320 aa  60.8  0.000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.46375  normal  0.0771435 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0724  hypothetical protein  43.75 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.262033 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0160  RND superfamily drug efflux protein  38.46 
 
 		 1089 aa  54.7  0.0000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.136412 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0171  RND superfamily drug efflux protein  38.46 
 
 		 1093 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.188694  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0180  RND superfamily drug efflux protein  38.46 
 
 		 1093 aa  54.7  0.0000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1138  hypothetical protein  63.16 
 
 		 175 aa  54.3  0.0000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2843  hypothetical protein  47.27 
 
 		 110 aa  51.6  0.000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.15317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0456  RND superfamily drug efflux protein  37.1 
 
 		 1110 aa  46.6  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.850885 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5044  hypothetical protein  33.78 
 
 		 184 aa  45.4  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0397  hypothetical protein  36.47 
 
 		 137 aa  44.3  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.334737  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3135  hypothetical protein  36.59 
 
 		 228 aa  41.2  0.008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.376033 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>