59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_0253 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009380  Strop_0253  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 
169 aa  332  1e-90  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0292  GCN5-related N-acetyltransferase  93.49 
 
 
169 aa  315  3e-85  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.238914 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1805  GCN5-related N-acetyltransferase  42.68 
 
 
176 aa  108  4.0000000000000004e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.00000000000000502354 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2067  GCN5-related N-acetyltransferase  41.83 
 
 
177 aa  100  9e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0243149  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3529  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 
159 aa  95.1  4e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0230339  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1622  CoA-binding domain protein  33.01 
 
 
894 aa  59.3  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000156668 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1628  GCN5-related N-acetyltransferase  34.02 
 
 
901 aa  56.2  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.321665  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_13180  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  32.32 
 
 
909 aa  51.6  0.000005  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.135541  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1606  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  37.5 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01395  hypothetical protein  37.5 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1652  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  37.5 
 
 
178 aa  49.3  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1747  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  37.5 
 
 
179 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.188764  hitchhiker  8.5342400000000005e-19 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2233  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  37.5 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.309606 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1508  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  37.5 
 
 
178 aa  48.9  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2220  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.213395  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01384  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  37.5 
 
 
179 aa  49.3  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1700  GCN5-related N-acetyltransferase  32.14 
 
 
187 aa  48.1  0.00006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14383  normal  0.117914 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_15880  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  31.91 
 
 
831 aa  46.2  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00274098  normal  0.158003 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_27480  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  31.31 
 
 
926 aa  45.8  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4749  GCN5-related N-acetyltransferase  29.7 
 
 
157 aa  45.4  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1416  GCN5-related N-acetyltransferase  32.97 
 
 
909 aa  45.8  0.0003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.953678  normal  0.831405 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1182  GCN5-related N-acetyltransferase  31.58 
 
 
158 aa  45.4  0.0003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0890  CoA-binding domain protein  28.57 
 
 
915 aa  45.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1628  CoA-binding domain protein  33.7 
 
 
821 aa  45.1  0.0005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00866172  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05850  acetyltransferase, ribosomal protein N-acetylase  39.76 
 
 
352 aa  44.7  0.0007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4101  GCN5-related N-acetyltransferase  38.03 
 
 
181 aa  44.3  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.526364 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1132  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
167 aa  44.3  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7067  Acyl-CoA synthetase (NDP forming)-like protein  36.56 
 
 
881 aa  43.5  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1840  GCN5-related N-acetyltransferase  40.26 
 
 
369 aa  43.5  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.422252  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3860  GCN5-related N-acetyltransferase  30 
 
 
162 aa  42.7  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.741843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6180  GCN5-related N-acetyltransferase  32.04 
 
 
155 aa  43.1  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1886  acetyltransferase  23.81 
 
 
295 aa  42.7  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.708702  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6906  GCN5-related N-acetyltransferase  34.78 
 
 
175 aa  42.7  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1929  GCN5-related protein N-acetyltransferase  33.33 
 
 
907 aa  43.5  0.002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.191743 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3343  GCN5-related N-acetyltransferase  29.21 
 
 
880 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0598594  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14440  acyl-CoA synthetase (NDP forming)  31.31 
 
 
908 aa  42.4  0.003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.268462  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3465  putative acyl-CoA synthetase  29.21 
 
 
880 aa  42.4  0.003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.063853  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1462  GCN5-related N-acetyltransferase  32 
 
 
868 aa  42.7  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.277001  normal  0.28701 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3206  putative acyl-CoA synthetase  29.21 
 
 
880 aa  42.4  0.003  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0517  hypothetical protein  25.49 
 
 
893 aa  42.4  0.003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3299  CoA-binding domain protein  30 
 
 
976 aa  42  0.004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0931  GCN5-related N-acetyltransferase  31.25 
 
 
189 aa  42  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.811036  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0556  GCN5-related N-acetyltransferase  35.9 
 
 
177 aa  41.6  0.005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000991626 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6199  GCN5-related N-acetyltransferase  34.69 
 
 
173 aa  41.6  0.005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1934  acetyltransferase  21.98 
 
 
295 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3234  acetyltransferase, GNAT family  19.59 
 
 
295 aa  41.2  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.157565 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2081  acetyltransferase  21.98 
 
 
295 aa  41.6  0.006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34810  diaminobutyrate acetyltransferase  35.8 
 
 
177 aa  41.2  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.308653 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1550  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  28.71 
 
 
179 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1789  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  28.71 
 
 
179 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  hitchhiker  0.00788192  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1725  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  28.71 
 
 
179 aa  41.2  0.007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05787  hypothetical protein  23.81 
 
 
877 aa  40.8  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1548  CoA-binding domain protein  28.12 
 
 
899 aa  40.8  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.25767  normal  0.134976 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1731  ribosomal-protein-L7/L12-serine acetyltransferase  28.71 
 
 
179 aa  41.2  0.008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.415259  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3077  GCN5-related N-acetyltransferase  33.77 
 
 
185 aa  40.8  0.009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2271  GCN5-related N-acetyltransferase  33.33 
 
 
178 aa  40.8  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5702  GCN5-related N-acetyltransferase  32.29 
 
 
233 aa  40.8  0.009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.384469 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2112  acetyltransferase, GNAT family  23.81 
 
 
295 aa  40.8  0.009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0112  GCN5-related N-acetyltransferase  27.27 
 
 
162 aa  40.8  0.01  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.185677 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>