46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_34810 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_34810  diaminobutyrate acetyltransferase  100 
 
 
177 aa  358  2e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.308653 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2066  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  56 
 
 
175 aa  169  1e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5811  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  54.09 
 
 
179 aa  167  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24800  diaminobutyrate acetyltransferase  52.87 
 
 
179 aa  164  5.9999999999999996e-40  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.499347  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1192  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  51.18 
 
 
214 aa  159  2e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.146998  normal  0.28094 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1557  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  48.84 
 
 
176 aa  157  9e-38  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19640  diaminobutyrate acetyltransferase  51.72 
 
 
173 aa  157  1e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00333065 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5212  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  50.31 
 
 
196 aa  152  2.9999999999999998e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.272297  normal  0.410721 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0300  putative acetyltransferase  50 
 
 
190 aa  136  2e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1562  proteinase inhibitor I3, Kunitz legume  42.11 
 
 
162 aa  132  1.9999999999999998e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1346  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  38.99 
 
 
167 aa  130  1.0000000000000001e-29  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0148094 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1876  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  45.22 
 
 
194 aa  129  3e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  hitchhiker  0.00346879  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0147  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  43.11 
 
 
171 aa  128  5.0000000000000004e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.648392  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1189  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  39.75 
 
 
173 aa  125  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.328752 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1732  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  36.54 
 
 
163 aa  122  2e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.995947  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0518  GCN5-related N-acetyltransferase  41.56 
 
 
176 aa  121  6e-27  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.253016  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4832  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  42.31 
 
 
198 aa  121  6e-27  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.834176 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5274  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  43.21 
 
 
194 aa  120  9.999999999999999e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2949  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  43.56 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4417  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  41.03 
 
 
195 aa  118  3.9999999999999996e-26  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.472783  normal  0.69771 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1158  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  41.25 
 
 
179 aa  118  4.9999999999999996e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.0000301374  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4256  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  41.03 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.424099  normal  0.0799551 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4190  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  41.03 
 
 
195 aa  117  9.999999999999999e-26  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.246717  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3008  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  41.94 
 
 
169 aa  115  3.9999999999999997e-25  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0194  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  39.22 
 
 
162 aa  104  8e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.952141  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0962  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  33.54 
 
 
168 aa  101  5e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003605  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  38.51 
 
 
177 aa  101  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0551  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  41.45 
 
 
183 aa  98.6  5e-20  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0409  L-2,4-diaminobutyric acid acetyltransferase  37.42 
 
 
173 aa  97.4  9e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000240892  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02454  hypothetical protein  35.95 
 
 
181 aa  93.2  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17770  acetyltransferase  39.29 
 
 
157 aa  55.1  0.0000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.356632 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2040  GCN5-related N-acetyltransferase  38.33 
 
 
156 aa  47.8  0.00008  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4333  GCN5-related N-acetyltransferase  30.91 
 
 
169 aa  46.2  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.156347 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3344  GCN5-related N-acetyltransferase  34.18 
 
 
205 aa  46.2  0.0003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0957  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  24.11 
 
 
176 aa  45.4  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3882  GCN5-related N-acetyltransferase  33.72 
 
 
163 aa  45.1  0.0005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.775809  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  31.71 
 
 
197 aa  44.7  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5353  GCN5-related N-acetyltransferase  34.09 
 
 
151 aa  43.1  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.884744  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5642  GCN5-related N-acetyltransferase  30.12 
 
 
153 aa  43.1  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0325  GCN5-related N-acetyltransferase  31.11 
 
 
156 aa  42  0.004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2192  acetyltransferase, GNAT family  27.37 
 
 
156 aa  41.6  0.006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000286297 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5948  GCN5-related N-acetyltransferase  36.84 
 
 
312 aa  41.6  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3087  acetyltransferase, GNAT family  26.32 
 
 
156 aa  41.2  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.297391  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0253  GCN5-related N-acetyltransferase  35.8 
 
 
169 aa  41.2  0.008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.068745 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3426  GCN5-related N-acetyltransferase  34.91 
 
 
395 aa  41.2  0.009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.134019 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4155  GCN5-related N-acetyltransferase  30.68 
 
 
186 aa  40.8  0.009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.481727  normal  0.582134 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>