17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2062 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2062  hypothetical protein  100 
 
 
69 aa  142  2e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000919693  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1147  hypothetical protein  47.06 
 
 
79 aa  65.5  0.0000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.62198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1158  hypothetical protein  39.71 
 
 
73 aa  62.8  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  hitchhiker  0.00402428  hitchhiker  0.0000171721 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4662  hypothetical protein  42.62 
 
 
74 aa  60.8  0.000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.2161  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0820  hypothetical protein  43.4 
 
 
74 aa  57.8  0.00000005  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2547  hypothetical protein  41.27 
 
 
77 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0550  hypothetical protein  39.13 
 
 
74 aa  53.1  0.000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0129436  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3239  hypothetical protein  33.33 
 
 
76 aa  50.8  0.000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.551481  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2918  hypothetical protein  34.38 
 
 
75 aa  48.9  0.00002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.386014 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0609  hypothetical protein  32.81 
 
 
74 aa  49.3  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008761  Pnap_4786  hypothetical protein  38.18 
 
 
66 aa  48.9  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1259  hypothetical protein  37.31 
 
 
74 aa  44.7  0.0004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1825  hypothetical protein  28.57 
 
 
73 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0426  hypothetical protein  28.79 
 
 
77 aa  42.7  0.002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5132  hypothetical protein  31.67 
 
 
66 aa  42.4  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.569085  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0024  hypothetical protein  23.44 
 
 
77 aa  40  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1887  hypothetical protein  30.3 
 
 
80 aa  40  0.01  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.127814  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>