13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2411 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2411  conserved hypothetical protein  100 
 
 
154 aa  316  7e-86  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.153936  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1553  hypothetical protein  74.34 
 
 
153 aa  240  3.9999999999999997e-63  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0776  hypothetical protein  66 
 
 
153 aa  186  7e-47  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1242  hypothetical protein  33.33 
 
 
144 aa  67.4  0.00000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1454  hypothetical protein  30.32 
 
 
140 aa  64.3  0.0000000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2097  conserved hypothetical protein  28.48 
 
 
143 aa  61.2  0.000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1549  hypothetical protein  27.7 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.0341965 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0484  hypothetical protein  28.28 
 
 
130 aa  51.2  0.000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.0107148 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0167  peroxiredoxin family protein  26.53 
 
 
137 aa  50.8  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.89255 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1804  hypothetical protein  28.87 
 
 
135 aa  46.2  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  decreased coverage  0.0031996  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1403  hypothetical protein  26.09 
 
 
149 aa  42.7  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.148167  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0352  hypothetical protein  26.53 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0525  hypothetical protein  27.03 
 
 
137 aa  40.8  0.008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.865789 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>