16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2338 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001800  Ssol_2338  conserved hypothetical protein  100 
 
 		 107 aa  207  3e-53  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.674166  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2726  PilT protein domain protein  49.48 
 
 		 131 aa  67  0.00000000007  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0340205  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1390  PilT domain-containing protein  32.99 
 
 		 135 aa  58.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0930438  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2139  hypothetical protein  35 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.804085  normal  0.443514 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9186  PilT protein, N-terminal  33.65 
 
 		 146 aa  55.1  0.0000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1049  PilT domain-containing protein  35.23 
 
 		 99 aa  53.5  0.0000009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.236676  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1378  hypothetical protein  39.6 
 
 		 136 aa  52  0.000003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.438265  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1536  PilT domain-containing protein  30 
 
 		 137 aa  50.8  0.000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.798578 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1065  PilT domain-containing protein  34.78 
 
 		 135 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3700  PilT protein domain protein  34.78 
 
 		 130 aa  44.7  0.0004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2191  PilT domain-containing protein  29.27 
 
 		 141 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.556042  normal  0.493855 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1460  hypothetical protein  40.91 
 
 		 105 aa  42  0.003  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  decreased coverage  0.00470768  hitchhiker  0.00200676 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4637  PilT domain-containing protein  42.55 
 
 		 141 aa  41.2  0.005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0894  PilT protein domain protein  25.53 
 
 		 141 aa  40.8  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.225314  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0338  hypothetical protein  27 
 
 		 132 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.4702  normal  1 
 
 
-
 
NC_011991  Avi_9511  nucleic acid-binding protein  36.36 
 
 		 139 aa  40  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.114328  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>