23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_2228 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_2228  conserved hypothetical protein  100 
 
 
903 aa  1791    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0618  solute binding protein-like protein  27.73 
 
 
820 aa  273  1e-71  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1897  cell wall anchor domain-containing protein  26.38 
 
 
878 aa  221  6e-56  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1418  cell wall anchor domain-containing protein  24.72 
 
 
863 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.939763  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0975  oligopeptide binding protein, putative  25.43 
 
 
867 aa  207  5e-52  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.200479 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0800  solute binding protein-like protein  27.74 
 
 
919 aa  204  6e-51  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0913  cell wall anchor domain-containing protein  25.82 
 
 
868 aa  200  7.999999999999999e-50  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.694923 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0149  solute binding protein-like protein  24.91 
 
 
895 aa  179  2e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.450727  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1072  putative lipoprotein  23.82 
 
 
871 aa  158  4e-37  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.000214841  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1074  solute binding protein-like protein  22.59 
 
 
843 aa  148  4.0000000000000006e-34  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.297086  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2180  solute binding protein-like protein  22.58 
 
 
862 aa  142  1.9999999999999998e-32  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.521964  normal  0.207273 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1065  oligopeptide binding protein, putative  22.59 
 
 
701 aa  136  9.999999999999999e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  unclonable  0.000000159871  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0396  extracellular solute-binding protein family 5  23.6 
 
 
868 aa  132  3e-29  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13080  lipoprotein, putative  23.3 
 
 
612 aa  97.1  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3677  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.57 
 
 
520 aa  58.9  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.969921  normal  0.0940549 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0723  hypothetical protein  25.58 
 
 
527 aa  52.8  0.00003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.703564  normal  0.46015 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3678  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  26.1 
 
 
525 aa  50.4  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0885273 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4398  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 
513 aa  48.5  0.0005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0482953  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4109  extracellular solute-binding protein family 5  27.22 
 
 
513 aa  48.5  0.0006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.344383  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13090  lipoprotein, putative  44.19 
 
 
198 aa  48.1  0.0007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1274  extracellular solute-binding protein  28.99 
 
 
794 aa  47.4  0.001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000437479 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3971  extracellular solute-binding protein family 5  24.09 
 
 
518 aa  45.8  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1483  extracellular solute-binding protein  26.87 
 
 
551 aa  44.7  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.228319  normal  0.152124 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>