36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssol_1270 on replicon CP001800
Organism: Sulfolobus solfataricus 98/2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001800  Ssol_1270  diphthamide biosynthesis protein  100 
 
 
333 aa  682    Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1864  diphthamide biosynthesis protein  61.26 
 
 
332 aa  448  1e-125  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1803  diphthamide biosynthesis protein  34.91 
 
 
349 aa  194  2e-48  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3588  diphthamide biosynthesis protein  35.26 
 
 
353 aa  192  9e-48  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2799  diphthamide biosynthesis protein  32.92 
 
 
349 aa  186  5e-46  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.815597  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0813  diphthamide biosynthesis protein  33.13 
 
 
347 aa  181  1e-44  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2492  diphthamide biosynthesis protein  32.04 
 
 
348 aa  181  2e-44  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0218  hypothetical protein  33.54 
 
 
316 aa  178  1e-43  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0882  diphthamide biosynthesis protein  32.09 
 
 
340 aa  177  3e-43  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1436  diphthamide biosynthesis protein  31.37 
 
 
331 aa  170  4e-41  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2168  diphthamide biosynthesis protein  32.38 
 
 
317 aa  169  6e-41  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1634  diphthamide synthase subunit  31.79 
 
 
335 aa  159  5e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1846  diphthamide biosynthesis protein  30.16 
 
 
315 aa  157  2e-37  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2613  diphthamide biosynthesis protein  33.11 
 
 
295 aa  154  2.9999999999999998e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1635  diphthamide biosynthesis protein  31.01 
 
 
334 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2082  diphthamide biosynthesis protein  33.23 
 
 
315 aa  148  2.0000000000000003e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1563  diphthamide biosynthesis protein  30.84 
 
 
331 aa  143  3e-33  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0484  diphthamide biosynthesis protein  27.73 
 
 
325 aa  135  9.999999999999999e-31  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1187  diphthamide biosynthesis protein  27 
 
 
309 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.20081  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1488  diphthamide biosynthesis protein  26.71 
 
 
309 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0764  diphthamide biosynthesis protein  27.22 
 
 
309 aa  127  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1190  diphthamide biosynthesis protein  27.89 
 
 
309 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0905  diphthamide biosynthesis protein  30.09 
 
 
331 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43090  predicted protein  25.66 
 
 
452 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0109024  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35812  predicted protein  28.18 
 
 
421 aa  113  4.0000000000000004e-24  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0979008 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20589  predicted protein  26.67 
 
 
434 aa  99  1e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07400  cytoplasm protein, putative  25.12 
 
 
529 aa  88.6  1e-16  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.185161  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1133  diphthamide biosynthesis protein  25.15 
 
 
337 aa  85.1  0.000000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.45882 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0393  diphthamide biosynthesis protein  24.68 
 
 
303 aa  67  0.0000000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0784701 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1114  diphthamide biosynthesis protein  23.18 
 
 
302 aa  60.8  0.00000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06283  Diphthamide biosynthesis protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZJ7]  25.93 
 
 
193 aa  59.7  0.00000007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.558592  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1360  hypothetical protein  22.52 
 
 
303 aa  57.8  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00886743 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1734  hypothetical protein  21.82 
 
 
303 aa  53.9  0.000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00147027 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_83454  predicted protein  27.27 
 
 
560 aa  50.1  0.00005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.171187 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02230  peptidyl-diphthamide biosynthesis, putative  18.77 
 
 
515 aa  44.7  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1545  D-amino-acid dehydrogenase  22.07 
 
 
406 aa  42.7  0.008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>