33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aboo_0484 on replicon NC_013926
Organism: Aciduliprofundum boonei T469



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013926  Aboo_0484  diphthamide biosynthesis protein  100 
 
 
325 aa  664    Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1436  diphthamide biosynthesis protein  39.45 
 
 
331 aa  249  5e-65  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1634  diphthamide synthase subunit  37.73 
 
 
335 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1846  diphthamide biosynthesis protein  38.15 
 
 
315 aa  219  6e-56  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2492  diphthamide biosynthesis protein  36.06 
 
 
348 aa  206  5e-52  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2168  diphthamide biosynthesis protein  36.88 
 
 
317 aa  202  5e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3588  diphthamide biosynthesis protein  34.65 
 
 
353 aa  197  3e-49  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1635  diphthamide biosynthesis protein  35.08 
 
 
334 aa  196  4.0000000000000005e-49  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1803  diphthamide biosynthesis protein  33.13 
 
 
349 aa  195  7e-49  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0218  hypothetical protein  35.08 
 
 
316 aa  195  7e-49  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2799  diphthamide biosynthesis protein  34.65 
 
 
349 aa  195  7e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.815597  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2613  diphthamide biosynthesis protein  35.76 
 
 
295 aa  188  1e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0813  diphthamide biosynthesis protein  33.33 
 
 
347 aa  183  4.0000000000000006e-45  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2082  diphthamide biosynthesis protein  33.02 
 
 
315 aa  177  2e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1864  diphthamide biosynthesis protein  33.12 
 
 
332 aa  150  2e-35  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1270  diphthamide biosynthesis protein  27.73 
 
 
333 aa  135  9.999999999999999e-31  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0882  diphthamide biosynthesis protein  29.69 
 
 
340 aa  132  9e-30  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1563  diphthamide biosynthesis protein  27.87 
 
 
331 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0905  diphthamide biosynthesis protein  26.11 
 
 
331 aa  109  6e-23  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0764  diphthamide biosynthesis protein  25.22 
 
 
309 aa  106  7e-22  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1488  diphthamide biosynthesis protein  24.85 
 
 
309 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1187  diphthamide biosynthesis protein  24.55 
 
 
309 aa  101  2e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.20081  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1190  diphthamide biosynthesis protein  24.44 
 
 
309 aa  97.4  3e-19  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43090  predicted protein  24.02 
 
 
452 aa  95.5  1e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0109024  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20589  predicted protein  27.3 
 
 
434 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35812  predicted protein  25.57 
 
 
421 aa  94  3e-18  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0979008 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1133  diphthamide biosynthesis protein  26.49 
 
 
337 aa  69.7  0.00000000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.45882 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1114  diphthamide biosynthesis protein  24.74 
 
 
302 aa  69.7  0.00000000006  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1360  hypothetical protein  25.34 
 
 
303 aa  64.3  0.000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00886743 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07400  cytoplasm protein, putative  22.82 
 
 
529 aa  63.5  0.000000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.185161  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0393  diphthamide biosynthesis protein  23.1 
 
 
303 aa  61.6  0.00000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0784701 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1734  hypothetical protein  22.41 
 
 
303 aa  55.8  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00147027 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32667  predicted protein  26.26 
 
 
517 aa  45.1  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.563535  normal  0.65168 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>