32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1563 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1563  diphthamide biosynthesis protein  100 
 
 
331 aa  674    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1436  diphthamide biosynthesis protein  31.58 
 
 
331 aa  156  4e-37  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0218  hypothetical protein  32.36 
 
 
316 aa  156  4e-37  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1634  diphthamide synthase subunit  33.56 
 
 
335 aa  151  2e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1270  diphthamide biosynthesis protein  30.84 
 
 
333 aa  143  3e-33  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2168  diphthamide biosynthesis protein  31.53 
 
 
317 aa  133  3.9999999999999996e-30  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1846  diphthamide biosynthesis protein  30.72 
 
 
315 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0484  diphthamide biosynthesis protein  27.87 
 
 
325 aa  128  1.0000000000000001e-28  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1864  diphthamide biosynthesis protein  26.93 
 
 
332 aa  121  1.9999999999999998e-26  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2799  diphthamide biosynthesis protein  28.34 
 
 
349 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.815597  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0882  diphthamide biosynthesis protein  27.96 
 
 
340 aa  116  3.9999999999999997e-25  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1635  diphthamide biosynthesis protein  27.86 
 
 
334 aa  114  3e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1803  diphthamide biosynthesis protein  27.51 
 
 
349 aa  112  9e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43090  predicted protein  26.32 
 
 
452 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0109024  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3588  diphthamide biosynthesis protein  28.25 
 
 
353 aa  109  6e-23  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0813  diphthamide biosynthesis protein  28.13 
 
 
347 aa  109  6e-23  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2613  diphthamide biosynthesis protein  28.66 
 
 
295 aa  109  7.000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2492  diphthamide biosynthesis protein  27.56 
 
 
348 aa  106  5e-22  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2082  diphthamide biosynthesis protein  28.62 
 
 
315 aa  97.1  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20589  predicted protein  28.25 
 
 
434 aa  86.3  7e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35812  predicted protein  31.74 
 
 
421 aa  79.3  0.00000000000009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0979008 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1190  diphthamide biosynthesis protein  22.41 
 
 
309 aa  69.7  0.00000000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1488  diphthamide biosynthesis protein  22.33 
 
 
309 aa  68.9  0.0000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1187  diphthamide biosynthesis protein  20.86 
 
 
309 aa  65.1  0.000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.20081  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0764  diphthamide biosynthesis protein  21.48 
 
 
309 aa  64.7  0.000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006670  CNA07400  cytoplasm protein, putative  30 
 
 
529 aa  53.9  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.185161  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0905  diphthamide biosynthesis protein  21.62 
 
 
331 aa  52.8  0.000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1133  diphthamide biosynthesis protein  22.26 
 
 
337 aa  50.4  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.45882 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1360  hypothetical protein  24.84 
 
 
303 aa  50.4  0.00004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00886743 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06283  Diphthamide biosynthesis protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZJ7]  23.56 
 
 
193 aa  48.1  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.558592  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1114  diphthamide biosynthesis protein  30.37 
 
 
302 aa  48.1  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02230  peptidyl-diphthamide biosynthesis, putative  20.25 
 
 
515 aa  47  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>