34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_1846 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_1846  diphthamide biosynthesis protein  100 
 
 
315 aa  628  1e-179  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2168  diphthamide biosynthesis protein  64.95 
 
 
317 aa  405  1.0000000000000001e-112  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.614157  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2082  diphthamide biosynthesis protein  62.9 
 
 
315 aa  387  1e-106  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.829732 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0218  hypothetical protein  52.7 
 
 
316 aa  352  4e-96  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2613  diphthamide biosynthesis protein  59.39 
 
 
295 aa  350  3e-95  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1634  diphthamide synthase subunit  45.86 
 
 
335 aa  286  2.9999999999999996e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1436  diphthamide biosynthesis protein  42.99 
 
 
331 aa  267  2e-70  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1635  diphthamide biosynthesis protein  45.07 
 
 
334 aa  253  2.0000000000000002e-66  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2799  diphthamide biosynthesis protein  40.63 
 
 
349 aa  239  2.9999999999999997e-62  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.815597  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2492  diphthamide biosynthesis protein  39.87 
 
 
348 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3588  diphthamide biosynthesis protein  39.68 
 
 
353 aa  227  2e-58  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1803  diphthamide biosynthesis protein  38.36 
 
 
349 aa  226  4e-58  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0484  diphthamide biosynthesis protein  38.15 
 
 
325 aa  219  6e-56  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0813  diphthamide biosynthesis protein  37.66 
 
 
347 aa  215  8e-55  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.528127 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1270  diphthamide biosynthesis protein  30.16 
 
 
333 aa  157  2e-37  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0882  diphthamide biosynthesis protein  37.91 
 
 
340 aa  147  3e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1864  diphthamide biosynthesis protein  33.44 
 
 
332 aa  145  1e-33  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.866923 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1563  diphthamide biosynthesis protein  30.72 
 
 
331 aa  132  6e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009368  OSTLU_43090  predicted protein  32.81 
 
 
452 aa  105  8e-22  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0109024  normal  0.0260674 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20589  predicted protein  30.77 
 
 
434 aa  105  8e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0905  diphthamide biosynthesis protein  21.96 
 
 
331 aa  105  1e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1488  diphthamide biosynthesis protein  26.23 
 
 
309 aa  104  2e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1187  diphthamide biosynthesis protein  25.16 
 
 
309 aa  103  3e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.20081  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1190  diphthamide biosynthesis protein  24.46 
 
 
309 aa  103  4e-21  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0764  diphthamide biosynthesis protein  26.46 
 
 
309 aa  103  4e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_35812  predicted protein  26.81 
 
 
421 aa  80.9  0.00000000000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.0979008 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1360  hypothetical protein  30.77 
 
 
303 aa  77.4  0.0000000000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  hitchhiker  0.00886743 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1114  diphthamide biosynthesis protein  35.82 
 
 
302 aa  72.8  0.000000000007  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0393  diphthamide biosynthesis protein  27.27 
 
 
303 aa  70.9  0.00000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.0784701 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1734  hypothetical protein  34.09 
 
 
303 aa  58.5  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  hitchhiker  0.00147027 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1133  diphthamide biosynthesis protein  28.74 
 
 
337 aa  56.2  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal  0.45882 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07400  cytoplasm protein, putative  21.98 
 
 
529 aa  48.9  0.0001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.185161  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06283  Diphthamide biosynthesis protein 1 [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5AZJ7]  26.74 
 
 
193 aa  44.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.558592  normal  0.316973 
 
 
-
 
NC_006682  CNM02230  peptidyl-diphthamide biosynthesis, putative  24.37 
 
 
515 aa  44.3  0.003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>